More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_12780 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_12780  putative two-component response regulator  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1160  putative two-component response regulator  98.56 
 
 		 209 aa  413  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4151  DNA-binding response regulator, LuxR family  59.62 
 
 		 208 aa  255  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3890  LuxR response regulator receiver  59.62 
 
 		 208 aa  255  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4515  two component LuxR family transcriptional regulator  59.13 
 
 		 208 aa  252  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2093  putative two-component response regulator  59.72 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1119  two component LuxR family transcriptional regulator  58.45 
 
 		 208 aa  240  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24710  putative two-component response regulator  59.72 
 
 		 207 aa  240  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2114  LuxR response regulator receiver  54.81 
 
 		 212 aa  235  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4322  two component LuxR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 207 aa  235  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  56.73 
 
 		 236 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.796271  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1090  LuxR family DNA-binding response regulator  56.52 
 
 		 207 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3974  two component LuxR family transcriptional regulator  55.29 
 
 		 208 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2101  LuxR family DNA-binding response regulator  54.81 
 
 		 207 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00862279  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3638  two component LuxR family transcriptional regulator  54.81 
 
 		 205 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1620  two component LuxR family transcriptional regulator  55.66 
 
 		 206 aa  231  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0222153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 205 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.003137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  53.17 
 
 		 207 aa  224  9e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0174  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.66 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0036  putative two-component response regulator  54.81 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.035019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00430  putative two-component response regulator  54.81 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.247974 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5714  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 210 aa  195  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2781  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 204 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4470  two component LuxR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370568  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4331  two component LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.748519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5940  LuxR family response regulator  43.6 
 
 		 220 aa  181  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000781929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  43.75 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  43.75 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  43.75 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6883  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239531  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1863  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  43.27 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  43.27 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2928  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5536  LuxR response regulator receiver  42.65 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882777  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2350  two component LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3412  LuxR family DNA-binding response regulator  47.37 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2528  two component LuxR family transcriptional regulator  46.19 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0522002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00485  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.51 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  42.51 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00490  hypothetical protein  42.51 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  42.51 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0577  transcriptional regulator FimZ  42.03 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0636  transcriptional regulator FimZ  42.03 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.931873  normal  0.250092 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0580  transcriptional regulator FimZ  42.03 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2269  two component LuxR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2160  LuxR family DNA-binding response regulator  38.65 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2113  LuxR family DNA-binding response regulator  38.16 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2738  DNA-binding transcriptional activator EvgA  37.07 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4334  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02279  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with EvgS  37.07 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1288  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1300  DNA-binding transcriptional activator EvgA  37.07 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2519  DNA-binding transcriptional activator EvgA  37.07 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3600  DNA-binding transcriptional activator EvgA  37.07 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0441797 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02240  hypothetical protein  37.07 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2655  DNA-binding transcriptional activator EvgA  37.07 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2506  DNA-binding transcriptional activator EvgA  37.07 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00265649  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6866  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140006  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0462  transcriptional regulator FimZ  40.96 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.739138  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  37.8 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 213 aa  141  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2906  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1808  two component LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 207 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000516369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.55 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2685  two component LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.120511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0459  two component LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.18 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.89 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1985  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.12 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  32.86 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2911  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.62 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0347  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.12 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1668  response regulator receiver  34.12 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.27 
 
 		 212 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  35.68 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  35.68 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  31.58 
 
 		 214 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  32.38 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0896  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0522  LuxR response regulator receiver  34.95 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000276468  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0998  response regulator  32.86 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.02 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 222 aa  121  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.74 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.82 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>