More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10770 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.69 
 
 
1625 aa  885    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.86 
 
 
1629 aa  885    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.89 
 
 
1659 aa  837    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.16 
 
 
1426 aa  1207    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.98 
 
 
1632 aa  793    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.86 
 
 
1629 aa  883    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  100 
 
 
1417 aa  2810    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  47.2 
 
 
1626 aa  895    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  93.44 
 
 
1418 aa  2508    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.85 
 
 
1560 aa  602  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
2654 aa  526  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.31 
 
 
1603 aa  520  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 
1374 aa  515  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
1245 aa  505  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.9 
 
 
1763 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
1767 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.67 
 
 
2213 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
1767 aa  486  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.3 
 
 
1768 aa  477  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 
1765 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
1767 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
1582 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33 
 
 
1765 aa  463  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
1782 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.38 
 
 
1611 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
1784 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  35.17 
 
 
1439 aa  458  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 
1792 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
1771 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
1786 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 
1622 aa  456  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  42.11 
 
 
1353 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
1202 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 
1326 aa  449  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.71 
 
 
1165 aa  445  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 
1340 aa  446  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  40.31 
 
 
2035 aa  446  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  43.07 
 
 
1030 aa  443  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1266 aa  442  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 
1267 aa  439  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.23 
 
 
1788 aa  439  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  38.41 
 
 
1683 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
1245 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  35.81 
 
 
1236 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
1238 aa  430  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  38 
 
 
1331 aa  428  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 
1236 aa  429  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 
1238 aa  429  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
1238 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  36.33 
 
 
1200 aa  429  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.81 
 
 
1548 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
1238 aa  429  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.37 
 
 
1236 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.37 
 
 
1236 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
1234 aa  429  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  36.07 
 
 
1188 aa  426  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
1234 aa  425  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
1230 aa  425  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.94 
 
 
1128 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
1193 aa  419  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 
1310 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
1236 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
1303 aa  418  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 
1005 aa  412  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 
1258 aa  412  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 
1284 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 
1158 aa  410  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
1033 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.45 
 
 
1233 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
1166 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 
1245 aa  403  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 
1009 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
920 aa  403  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  42.56 
 
 
1364 aa  400  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  39.08 
 
 
1574 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  38.4 
 
 
1287 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 
957 aa  396  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 
1240 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 
921 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 
929 aa  389  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
1369 aa  389  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 
1333 aa  389  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 
1021 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1333 aa  387  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 
1303 aa  385  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
916 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
1314 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 
912 aa  377  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  32.86 
 
 
1179 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
816 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.59 
 
 
1499 aa  372  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  40.99 
 
 
1135 aa  369  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
1959 aa  369  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
1611 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.52 
 
 
981 aa  369  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  36.17 
 
 
861 aa  370  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 
1643 aa  366  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
1578 aa  364  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 
1040 aa  363  1e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.98 
 
 
1468 aa  362  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>