More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_10110  putative transporter  100 
 
 
394 aa  743  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  1.08859e-10  normal  0.939917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3762  major facilitator transporter  66 
 
 
400 aa  398  1e-110  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.147545  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1617  major facilitator family transporter  65.92 
 
 
405 aa  399  1e-110  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  56.88 
 
 
414 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0640  major facilitator superfamily MFS_1  67.86 
 
 
395 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403686  normal  0.404462 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3708  major facilitator transporter  48.55 
 
 
386 aa  305  1e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26110  putative MFS transporter  57.76 
 
 
392 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.463026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2688  major facilitator family transporter  50.42 
 
 
384 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2421  major facilitator transporter  49.86 
 
 
384 aa  286  6e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0890  major facilitator transporter  45.56 
 
 
388 aa  265  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  37.88 
 
 
390 aa  186  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  35.78 
 
 
392 aa  186  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 
388 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  35.88 
 
 
388 aa  185  1e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  34.03 
 
 
391 aa  184  2e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  36.2 
 
 
391 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  34.03 
 
 
391 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  36.2 
 
 
390 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  33.67 
 
 
404 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  36.2 
 
 
390 aa  183  4e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  33.51 
 
 
391 aa  183  4e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  35.36 
 
 
400 aa  183  4e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  36.2 
 
 
390 aa  183  4e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  36.2 
 
 
390 aa  183  4e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  36.2 
 
 
390 aa  183  4e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  36.2 
 
 
390 aa  183  4e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  36.2 
 
 
390 aa  183  5e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  36.2 
 
 
391 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  34.85 
 
 
391 aa  183  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  35.91 
 
 
390 aa  182  9e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  33.77 
 
 
391 aa  182  9e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  33.77 
 
 
391 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  34.83 
 
 
400 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  32.34 
 
 
404 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  35.31 
 
 
391 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 
404 aa  179  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  33.16 
 
 
415 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  35.45 
 
 
400 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  37.04 
 
 
378 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  33.97 
 
 
394 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  34.56 
 
 
400 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  34.56 
 
 
400 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  32.4 
 
 
404 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.89169e-08 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  33.43 
 
 
391 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  34.56 
 
 
400 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  35.45 
 
 
400 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  33.42 
 
 
404 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  35.9 
 
 
409 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  33.42 
 
 
415 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  33.42 
 
 
404 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  35.01 
 
 
416 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  35.01 
 
 
391 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  34.83 
 
 
391 aa  175  1e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  37.16 
 
 
395 aa  175  1e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  32.89 
 
 
406 aa  174  2e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  4.43507e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  35.99 
 
 
387 aa  174  3e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  34.56 
 
 
400 aa  173  4e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.16 
 
 
388 aa  173  4e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  37.92 
 
 
389 aa  173  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  37.18 
 
 
388 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  35.99 
 
 
395 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 
391 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  37.24 
 
 
391 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  35.71 
 
 
395 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  31.28 
 
 
404 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  31.28 
 
 
404 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  35.81 
 
 
401 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  31.28 
 
 
404 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  31.28 
 
 
404 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  36.9 
 
 
388 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  31.63 
 
 
404 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  31.28 
 
 
404 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 
400 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  34.79 
 
 
397 aa  170  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  35.19 
 
 
388 aa  170  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  31.91 
 
 
387 aa  170  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4299  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
391 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0867  major facilitator transporter  30.3 
 
 
391 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  35.99 
 
 
389 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  36.07 
 
 
399 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  36.95 
 
 
391 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  34.26 
 
 
389 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  37.58 
 
 
408 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2061  major facilitator transporter  36.02 
 
 
401 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  33.61 
 
 
396 aa  167  3e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  34.26 
 
 
408 aa  167  3e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 
400 aa  167  3e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  1.6872e-07 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 
397 aa  167  3e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  37.58 
 
 
401 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  33.95 
 
 
389 aa  166  6e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  33.95 
 
 
389 aa  166  6e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  33.95 
 
 
389 aa  166  6e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  33.95 
 
 
389 aa  166  6e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  9.71933e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  33.95 
 
 
389 aa  166  6e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 
389 aa  166  6e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  33.95 
 
 
389 aa  166  6e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.69291e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  36.96 
 
 
401 aa  166  7e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  36.96 
 
 
401 aa  166  7e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  36.96 
 
 
401 aa  166  7e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  36.96 
 
 
401 aa  166  7e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>