48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_09810 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  473  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  90.79 
 
 
239 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  64.89 
 
 
228 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  64.89 
 
 
228 aa  308  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  64.89 
 
 
228 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  64.44 
 
 
228 aa  307  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  64 
 
 
228 aa  305  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  62.22 
 
 
228 aa  300  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  58.49 
 
 
227 aa  258  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  54.97 
 
 
228 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  46.22 
 
 
222 aa  178  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  48.15 
 
 
240 aa  168  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  50.9 
 
 
235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  43.61 
 
 
242 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  48.52 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  41.91 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  44.78 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  43.28 
 
 
241 aa  112  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  38.85 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  38.06 
 
 
239 aa  101  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  37.11 
 
 
236 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  35.29 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  33.1 
 
 
231 aa  95.1  8e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  34.02 
 
 
241 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  35.58 
 
 
230 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  36.3 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  37.78 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  31.82 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  36.62 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  35.56 
 
 
230 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  28.46 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  31.98 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  35.56 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  33.33 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  31.54 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  29.23 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  29.63 
 
 
224 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  28.15 
 
 
221 aa  52  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  29.67 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  28.92 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  29.93 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  28.67 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  25.96 
 
 
221 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  34.67 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  25.19 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  21.74 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  27.78 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
795 aa  42.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.188862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>