59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_08300 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  49.64 
 
 		 1051 aa  833    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  44.1 
 
 		 1341 aa  1107    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  46.73 
 
 		 1816 aa  1016    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  47.69 
 
 		 2007 aa  930    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  46.61 
 
 		 1194 aa  1064    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  39.16 
 
 		 1057 aa  706    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  37.11 
 
 		 1133 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  47.92 
 
 		 1092 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  48.04 
 
 		 1101 aa  797    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  52.55 
 
 		 1067 aa  926    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  100 
 
 		 1219 aa  2486    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  45.67 
 
 		 1100 aa  820    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  51.25 
 
 		 1061 aa  896    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  61.26 
 
 		 1188 aa  1535    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  90.58 
 
 		 1221 aa  2266    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  36.57 
 
 		 1103 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  36.66 
 
 		 3006 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  36.8 
 
 		 2140 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  29.6 
 
 		 1543 aa  442  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  36.22 
 
 		 3238 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  35.86 
 
 		 2900 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  36.08 
 
 		 3521 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  35.66 
 
 		 2899 aa  422  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  35.38 
 
 		 3286 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  32.32 
 
 		 1159 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1159 aa  412  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  33.72 
 
 		 1132 aa  412  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1137 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1132 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  33.52 
 
 		 1132 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  38.04 
 
 		 1116 aa  406  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  38.04 
 
 		 1116 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  31.74 
 
 		 1120 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  31.58 
 
 		 1120 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  32.96 
 
 		 1158 aa  386  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  35.36 
 
 		 1157 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  35.54 
 
 		 1159 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  32.96 
 
 		 1158 aa  386  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  35.54 
 
 		 1159 aa  383  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  35.41 
 
 		 1157 aa  383  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  35.36 
 
 		 1157 aa  376  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  29.55 
 
 		 1059 aa  345  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  33.2 
 
 		 1012 aa  343  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  37.28 
 
 		 522 aa  335  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  32.01 
 
 		 881 aa  254  9.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2089  host specificity protein J, internal deletion  37.26 
 
 		 1093 aa  248  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154474  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4041  host specificity protein J, internal deletion  37.26 
 
 		 1093 aa  247  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0753321  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  27.05 
 
 		 960 aa  191  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  34.31 
 
 		 951 aa  177  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  34.29 
 
 		 837 aa  176  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1353  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1830 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.169876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  31.1 
 
 		 348 aa  77  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1641  hypothetical protein  32.5 
 
 		 885 aa  68.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1583  hypothetical protein  30.24 
 
 		 1329 aa  65.1  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.917708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1874  hypothetical protein  31.25 
 
 		 885 aa  64.3  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.556351 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  21.18 
 
 		 1644 aa  62  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  22.41 
 
 		 918 aa  61.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3392  hypothetical protein  27.07 
 
 		 2400 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  26.81 
 
 		 934 aa  48.1  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>