44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_08250 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_08250  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0781  hypothetical protein  99.12 
 
 
113 aa  229  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2418  phage minor tail protein  40 
 
 
112 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0502911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3932  minor tail family protein  36.36 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2582  minor tail family protein  33.94 
 
 
111 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.509278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2779  Phage minor tail  36.36 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00996028  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2952  prophage LambdaSo, minor tail protein M, putative  34.21 
 
 
111 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2224  phage minor tail family protein  36.94 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1689  Phage minor tail protein  36.52 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1057  Phage minor tail protein  35.65 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0742722  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3100  minor tail family protein  35.71 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.033574  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1691  phage HK97 GP17-like protein  32.73 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.294427  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1637  Phage minor tail protein  35.09 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0450  LambdaSo, minor tail protein M  29.09 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0159877  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2201  phage minor tail protein  34.82 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3877  minor tail family protein  30.91 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266915  normal  0.28398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0884  phage minor tail protein  30.91 
 
 
109 aa  61.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1797  phage minor tail protein  30.91 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1873  phage minor tail protein  30.91 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3125  phage minor tail protein  30.91 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0375615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3193  phage minor tail protein  30.91 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2767  phage minor tail protein  30.91 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.805166 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2800  phage minor tail protein  35.19 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal  0.653749 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0704  phage minor tail protein  35.19 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1196  phage minor tail protein  30.91 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1883  phage minor tail  35.51 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0909  phage minor tail protein  33.33 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0090  phage minor tail protein  29.09 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2105  minor tail family protein  30.91 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000552364  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1152  phage minor tail protein  32.46 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1417  phage minor tail protein  32.46 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0253918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00746  hypothetical protein  30.91 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10050  tail component  30.91 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1080  phage minor tail protein  29.09 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1468  phage minor tail protein  30 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1634  phage minor tail protein  30 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.155069 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1199  phage minor tail protein  32.74 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607618 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1089  phage minor tail protein  37.63 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.674881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2172  phage minor tail protein  36.56 
 
 
113 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2236  phage minor tail protein  36.56 
 
 
113 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000997154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2882  phage minor tail protein  36.56 
 
 
113 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1550  phage minor tail protein  35.48 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0913332  hitchhiker  0.00355714 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5471  hypothetical protein  30.43 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6226  minor tail family protein  30.19 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>