113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_08070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  100 
 
 
386 aa  787    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  85.23 
 
 
386 aa  686    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  78.12 
 
 
388 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  76.44 
 
 
388 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  75.91 
 
 
387 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  75.52 
 
 
388 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  70.76 
 
 
389 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  45.64 
 
 
392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  45.38 
 
 
392 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  45.38 
 
 
392 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  44.25 
 
 
400 aa  316  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  42.42 
 
 
398 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  42.43 
 
 
405 aa  293  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  42.15 
 
 
391 aa  262  6e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  40.69 
 
 
474 aa  231  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  35.08 
 
 
389 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  36.29 
 
 
389 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  36.65 
 
 
390 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  35.34 
 
 
389 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  36.65 
 
 
390 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  36.48 
 
 
390 aa  227  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  35.96 
 
 
390 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  35.96 
 
 
390 aa  226  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  34.3 
 
 
389 aa  225  8e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  34.3 
 
 
389 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  34.3 
 
 
391 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  35.17 
 
 
389 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4856  tail sheath protein  34.47 
 
 
390 aa  222  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  34.55 
 
 
395 aa  222  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0185  tail sheath protein  35.53 
 
 
390 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  33.25 
 
 
389 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  33.93 
 
 
395 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  34.78 
 
 
396 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37400  Phage P2 tail sheath FI-like protein  33.68 
 
 
396 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  33.33 
 
 
396 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  34.12 
 
 
391 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  35.17 
 
 
388 aa  199  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  33.77 
 
 
391 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  34.03 
 
 
397 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  34.03 
 
 
397 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  30.63 
 
 
394 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1331  Phage tail sheath protein  33.6 
 
 
390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  34.8 
 
 
475 aa  179  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  34.8 
 
 
475 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  32.19 
 
 
501 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2675  phage tail sheath protein  33.16 
 
 
394 aa  170  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  0.0163922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2664  tail sheath protein  31.88 
 
 
397 aa  169  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  33.74 
 
 
475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  33.74 
 
 
475 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1945  phage tail sheath protein  33.59 
 
 
394 aa  166  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  35.2 
 
 
485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  33.44 
 
 
475 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  35.27 
 
 
476 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0227  major tail sheath protein  32.01 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  37.14 
 
 
478 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  36.86 
 
 
478 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0691  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.78 
 
 
485 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01996  hypothetical protein  26.09 
 
 
387 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2334  phage tail sheath protein  26.85 
 
 
420 aa  96.3  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  26.3 
 
 
401 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1145  Phage tail sheath protein FI-like  25.62 
 
 
388 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  29.62 
 
 
522 aa  82.8  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  28.81 
 
 
521 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  28.29 
 
 
522 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  25.88 
 
 
509 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  27.71 
 
 
544 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4130  hypothetical protein  25.24 
 
 
428 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.277985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  28.11 
 
 
514 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  30.22 
 
 
521 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  27.34 
 
 
596 aa  74.7  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  24.81 
 
 
585 aa  73.6  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0579  hypothetical protein  23.53 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.903684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  26.99 
 
 
521 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  26.99 
 
 
521 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  25.6 
 
 
522 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  28.21 
 
 
690 aa  70.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1212  hypothetical protein  25.58 
 
 
485 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  28.81 
 
 
542 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  26.1 
 
 
518 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  24.52 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  25.72 
 
 
638 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  27.57 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  24.69 
 
 
551 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  25.82 
 
 
512 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  28.96 
 
 
405 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  24.14 
 
 
660 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  26.71 
 
 
585 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  27.27 
 
 
1117 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  25.7 
 
 
724 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1491  hypothetical protein  23.11 
 
 
501 aa  60.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  25 
 
 
569 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2043  Phage tail sheath protein FI-like protein  34.78 
 
 
248 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751057  normal  0.823629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  27.72 
 
 
599 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  26.78 
 
 
686 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  24.71 
 
 
821 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  26.86 
 
 
802 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  24.76 
 
 
514 aa  52.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  25.61 
 
 
644 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  24.73 
 
 
394 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  25.27 
 
 
781 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>