More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_07260 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  95.29 
 
 
255 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  65.61 
 
 
255 aa  349  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  62.4 
 
 
255 aa  305  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  51.2 
 
 
259 aa  266  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  49.8 
 
 
257 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  55.42 
 
 
260 aa  260  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  55.2 
 
 
256 aa  252  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  40.93 
 
 
246 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  38.98 
 
 
239 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  38.98 
 
 
239 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  38.98 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 
247 aa  145  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  38.43 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  38.06 
 
 
243 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  40.25 
 
 
242 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  36.93 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
263 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  38.14 
 
 
275 aa  121  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 
245 aa  118  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  36.16 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
257 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  46.38 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  39.9 
 
 
243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 
270 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  36.5 
 
 
251 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  35.77 
 
 
251 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  35.77 
 
 
251 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  35.77 
 
 
251 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  35.77 
 
 
251 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  31.56 
 
 
256 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  29.34 
 
 
251 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86084  methyltransferase  26.52 
 
 
333 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0255585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  35.04 
 
 
251 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  40.43 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  38.26 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  32.9 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  36.94 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.5 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  38.41 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1753  putative methyltransferase  30.99 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.148038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  46.88 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.08 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03990  expressed protein  26.18 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1419  putative methyltransferase  30.99 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.412346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07070  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.76501  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
261 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1752  putative methyltransferase  33.33 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.610135  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3652  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  31.2 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  37.24 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  39.55 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0312  hypothetical protein  30.71 
 
 
142 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.763248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1418  putative methyltransferase  33.58 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.282901  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1471  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2869  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5557  Methyltransferase type 12  34.35 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5476  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608762  normal  0.384797 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  36.65 
 
 
250 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1629  hypothetical protein  31.39 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  40.46 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4278  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 
186 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.867588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  39.85 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  39.37 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
260 aa  62  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  29.26 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  38.52 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4328  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
188 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4141  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
273 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
250 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  28.36 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  41.22 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  25.74 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  24.89 
 
 
278 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 
277 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  35.29 
 
 
250 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5511  methyltransferase  30.65 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.139687  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  35.2 
 
 
254 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  39.1 
 
 
256 aa  55.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
264 aa  55.8  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  34.53 
 
 
253 aa  55.8  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 
255 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
211 aa  55.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 
252 aa  55.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 
255 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  31.21 
 
 
275 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  26.01 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  35.38 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>