More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_05340 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  100 
 
 		 178 aa  359  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  98.88 
 
 		 178 aa  357  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  82.29 
 
 		 177 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  60.67 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  63.69 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  58.99 
 
 		 179 aa  214  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  58.62 
 
 		 184 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  58.62 
 
 		 184 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  58.05 
 
 		 184 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  58.05 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  51.4 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  44.32 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  42.94 
 
 		 181 aa  137  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  40.94 
 
 		 176 aa  127  9.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  43.92 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  35.26 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  37.93 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  37.58 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  33.14 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  33.14 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  32.39 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  31.25 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  35.16 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  27.91 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  31.74 
 
 		 175 aa  72  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  33.53 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  33.53 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  31.2 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  28.23 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  34.78 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  27.71 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  32.52 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  27.78 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  30.25 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  30.43 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  30.3 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  25 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  31.85 
 
 		 531 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  27.52 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  30.99 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  31.03 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  24.09 
 
 		 466 aa  58.5  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  31.03 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  25 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  31.96 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  31.03 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.55 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  32.65 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  29.09 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  35.87 
 
 		 568 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  26.09 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  25 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  30.11 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  31.36 
 
 		 518 aa  55.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  30 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  27.21 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.49 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  25.49 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  25.49 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  25.49 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  25.83 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  29.63 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.38 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2380  CheW protein  24.39 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  29.17 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  28.21 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  30.4 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  24.84 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.49 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  25.49 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  25.49 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  30.09 
 
 		 162 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  25.49 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  29.75 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  23.94 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  30.25 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  29.25 
 
 		 313 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  24.49 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  25.49 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  25.49 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  25.98 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  31.65 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  29.77 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  23.2 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  26.96 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  24.67 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  29.71 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  26.89 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  31 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  28.32 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  25.45 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  22.13 
 
 		 148 aa  51.6  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  27.66 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  35.14 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  24 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1485  CheW protein  26.4 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02816 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  27.17 
 
 		 478 aa  51.2  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  30.47 
 
 		 157 aa  51.2  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  26.15 
 
 		 169 aa  51.2  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  25 
 
 		 161 aa  51.2  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>