177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_04590 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  307  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  98.73 
 
 
157 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  73.33 
 
 
152 aa  224  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  55.19 
 
 
162 aa  183  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  53.75 
 
 
162 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  58.67 
 
 
151 aa  176  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  57.66 
 
 
154 aa  170  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  55.26 
 
 
160 aa  170  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1441  phosphodiesterase, MJ0936 family  56 
 
 
150 aa  167  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0531917  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1020  phosphoesterase, putative  57.93 
 
 
159 aa  164  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  50.33 
 
 
155 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  49.02 
 
 
152 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  48.37 
 
 
152 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  47.37 
 
 
153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  47.71 
 
 
152 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  46.84 
 
 
174 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  47.65 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  45.32 
 
 
153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  48.03 
 
 
154 aa  124  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.61 
 
 
173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  41.61 
 
 
173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  41.61 
 
 
173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  37.82 
 
 
161 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.8 
 
 
196 aa  90.1  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1322  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.26 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0695947  normal  0.0513289 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.68 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  36.64 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.1 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.25 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  36.42 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03670  hypothetical protein  66.67 
 
 
86 aa  79  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  32.52 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.85 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1357  hypothetical protein  33.58 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.82 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.43 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  36.09 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  34.71 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  31.9 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1311  hypothetical protein  33.09 
 
 
188 aa  70.9  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  31.9 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.66 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  34.67 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  29.49 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  34.31 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
162 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0028  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.46 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.54449  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2971  metallophosphoesterase  30.53 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  30.86 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  31.43 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  28.05 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  38.75 
 
 
195 aa  63.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.03 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.93 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.3 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  29.71 
 
 
178 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.08 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  32.88 
 
 
188 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  29.8 
 
 
168 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  35.94 
 
 
166 aa  60.8  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  32.37 
 
 
173 aa  60.8  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2013  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.61 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.995963  normal  0.0956817 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  32.37 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.07 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.97 
 
 
175 aa  58.9  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.33 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  27.5 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  27.16 
 
 
171 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  29.11 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  28.74 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.04 
 
 
166 aa  57.8  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03671  hypothetical protein  52.63 
 
 
64 aa  57.4  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 
169 aa  57  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.19 
 
 
172 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  30.46 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  33.09 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  26.88 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  30.81 
 
 
187 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.59 
 
 
178 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  29.17 
 
 
184 aa  54.7  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  30 
 
 
171 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  29.14 
 
 
185 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  31.43 
 
 
171 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  30 
 
 
171 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  33.33 
 
 
168 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.21 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13528  hypothetical protein  26.06 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.48 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.56 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  31.48 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  30.06 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  34.06 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4666  phosphodiesterase  25.38 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  24.16 
 
 
196 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  30.43 
 
 
157 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  30.43 
 
 
157 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.49 
 
 
169 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  30.46 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>