49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_04490 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  52.4 
 
 
271 aa  271  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1730  methyltransferase FkbM  42.97 
 
 
342 aa  219  3e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  51.16 
 
 
243 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  45.95 
 
 
1644 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  45.95 
 
 
1644 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  47.06 
 
 
447 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  45.37 
 
 
456 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  45.13 
 
 
409 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  42.86 
 
 
785 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  45.37 
 
 
459 aa  189  5e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  42.48 
 
 
249 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  42.48 
 
 
249 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  39.3 
 
 
320 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1160  methyltransferase FkbM family  42.22 
 
 
879 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.080922  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  38.87 
 
 
444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  36.88 
 
 
477 aa  169  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  43.3 
 
 
314 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  35.94 
 
 
219 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  34.08 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  37.06 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  32.35 
 
 
231 aa  89.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1043  methyltransferase FkbM  31.21 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00514259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  28.41 
 
 
569 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2368  hypothetical protein  29.8 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  26.53 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2886  methyltransferase FkbM  33.08 
 
 
285 aa  52.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  28.4 
 
 
784 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2698  methyltransferase FkbM family  30.49 
 
 
579 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  34.74 
 
 
321 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2335  methyltransferase FkbM  24.68 
 
 
233 aa  49.3  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352701  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  30.32 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0263  methyltransferase FkbM family  33.1 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37903  predicted protein  24.4 
 
 
293 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166915  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2236  methyltransferase FkbM  30.92 
 
 
274 aa  47  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0046  methyltransferase FkbM family  23.49 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0044  methyltransferase FkbM family  23.49 
 
 
278 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170743  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  23.08 
 
 
322 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0320  methyltransferase FkbM family  33.55 
 
 
265 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1954  FkbM family methyltransferase  34.48 
 
 
272 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3684  methyltransferase FkbM  28.46 
 
 
262 aa  45.4  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4762  FkbM family methyltransferase  29.17 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175794  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1518  methyltransferase FkbM  30.17 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1955  FkbM family methyltransferase  30.32 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00902633 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1497  hypothetical protein  25.35 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0111137  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2750  methyltransferase FkbM  27.09 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1687  FkbM family methyltransferase  30.07 
 
 
296 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  25.4 
 
 
238 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2362  methyltransferase FkbM  30.82 
 
 
258 aa  42.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0747821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>