More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03610 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  100 
 
 
252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  96.03 
 
 
252 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  63.1 
 
 
250 aa  326  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  63.1 
 
 
250 aa  326  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  62.7 
 
 
250 aa  325  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  62.7 
 
 
250 aa  325  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  62.2 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  61.81 
 
 
253 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  61.81 
 
 
253 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  61.81 
 
 
253 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  61.81 
 
 
253 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  65.2 
 
 
251 aa  315  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  65.45 
 
 
250 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  59.29 
 
 
251 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  60.16 
 
 
252 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  60.16 
 
 
252 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  58.82 
 
 
254 aa  297  9e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  58.82 
 
 
254 aa  297  9e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  58.82 
 
 
254 aa  297  9e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  58.82 
 
 
254 aa  297  9e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  58.82 
 
 
254 aa  297  9e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  58.43 
 
 
262 aa  295  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  58.43 
 
 
254 aa  295  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  58.17 
 
 
252 aa  293  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  58.17 
 
 
252 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  58.17 
 
 
252 aa  293  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  58.17 
 
 
252 aa  293  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  58.17 
 
 
252 aa  292  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  58.17 
 
 
252 aa  292  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  60.85 
 
 
252 aa  292  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  57.77 
 
 
252 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  57.77 
 
 
252 aa  291  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0200008 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  60.34 
 
 
254 aa  289  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  65.45 
 
 
250 aa  290  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  59.6 
 
 
252 aa  286  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  62.44 
 
 
235 aa  285  5e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  60.71 
 
 
249 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  56.07 
 
 
250 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  62.45 
 
 
250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  55.82 
 
 
253 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  55.42 
 
 
253 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  55 
 
 
253 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  57.92 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  54.22 
 
 
253 aa  244  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  54.22 
 
 
253 aa  244  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  57.59 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  54.22 
 
 
604 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  52.38 
 
 
254 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  45.31 
 
 
256 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  44.59 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  46.48 
 
 
275 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  38.29 
 
 
289 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  40.54 
 
 
290 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  35.34 
 
 
269 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  28.68 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  26.54 
 
 
268 aa  87  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  29.06 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  28.4 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  26.95 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  29.35 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  28.16 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  31.22 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  28.37 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.31 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  29.22 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  27.85 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  29.84 
 
 
274 aa  77  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  32.26 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  27.68 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  26.54 
 
 
424 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  27.56 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  30.57 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  28.77 
 
 
269 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  25.98 
 
 
267 aa  75.1  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  27.68 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  24.55 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  24.14 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  29.02 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  29.02 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  29.41 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  26.85 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1773  putative metalloprotease  29.95 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.480116  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  31.65 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  29.49 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  29.1 
 
 
487 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  30.62 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  28.97 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  27.73 
 
 
271 aa  72  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  27.56 
 
 
280 aa  72  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  28.18 
 
 
266 aa  72  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  27.49 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  25.57 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  25.57 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  32.72 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  25.23 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  26.51 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  29.03 
 
 
445 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  30 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  27.15 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>