More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03490 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  300  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  96.55 
 
 
145 aa  292  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  68.75 
 
 
145 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  68.06 
 
 
145 aa  209  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  64.79 
 
 
143 aa  192  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.86 
 
 
145 aa  170  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  52.08 
 
 
145 aa  169  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.39 
 
 
145 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  54.17 
 
 
145 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  54.86 
 
 
145 aa  168  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.19 
 
 
153 aa  167  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  54.86 
 
 
149 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  54.86 
 
 
145 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.47 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  54.17 
 
 
145 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  52.41 
 
 
162 aa  163  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.78 
 
 
145 aa  163  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  49.66 
 
 
145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.66 
 
 
145 aa  160  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  52.08 
 
 
157 aa  160  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  48.97 
 
 
145 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  48.28 
 
 
145 aa  158  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.28 
 
 
145 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  48.28 
 
 
145 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  47.59 
 
 
145 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.71 
 
 
145 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.43 
 
 
152 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.43 
 
 
163 aa  154  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.34 
 
 
146 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.83 
 
 
146 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  46.53 
 
 
153 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.45 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  48.23 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.76 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.57 
 
 
163 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  41.13 
 
 
147 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.86 
 
 
163 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.06 
 
 
154 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  45.65 
 
 
154 aa  141  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  40.43 
 
 
147 aa  140  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.55 
 
 
155 aa  140  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  48.57 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.44 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  43.06 
 
 
159 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.82 
 
 
155 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  43.06 
 
 
159 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.06 
 
 
159 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  51.47 
 
 
152 aa  135  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.59 
 
 
152 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  49.3 
 
 
167 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.14 
 
 
159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  45.14 
 
 
159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.67 
 
 
159 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.67 
 
 
159 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2658  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.83 
 
 
151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764156  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.14 
 
 
153 aa  133  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 
159 aa  133  8e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  46.1 
 
 
158 aa  133  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 
159 aa  133  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.76 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  50.4 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  40.97 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  48.94 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.52 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.14 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.67 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.59 
 
 
156 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.67 
 
 
159 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.06 
 
 
159 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  48.28 
 
 
157 aa  130  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.09 
 
 
151 aa  130  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  42.86 
 
 
159 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 
159 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  41.84 
 
 
146 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.53 
 
 
163 aa  130  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.75 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.29 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.14 
 
 
157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 
159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  48.09 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.32 
 
 
143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  43.97 
 
 
150 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.1 
 
 
150 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  49.64 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.8 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.8 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.8 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.85 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.8 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.8 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  49.29 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3196  alkylhydroperoxidase  43.51 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4069  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  46.85 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3956  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405644  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 
167 aa  124  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.37 
 
 
151 aa  124  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.07 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  44.78 
 
 
149 aa  124  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  44.78 
 
 
149 aa  123  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>