45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03390 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_03390  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  349  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000152663  unclonable  2.59325e-22 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  49.7 
 
 		 391 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  52.32 
 
 		 401 aa  159  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  51.57 
 
 		 414 aa  157  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  46.89 
 
 		 435 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  49.68 
 
 		 397 aa  155  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  47.56 
 
 		 412 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  46.29 
 
 		 411 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  47.9 
 
 		 433 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  47.4 
 
 		 471 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  43.9 
 
 		 392 aa  140  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  43.29 
 
 		 392 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  43.29 
 
 		 386 aa  124  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  38.29 
 
 		 407 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  34.66 
 
 		 407 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  36.77 
 
 		 384 aa  86.7  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  33.99 
 
 		 428 aa  64.7  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3069  integrase family protein  29.59 
 
 		 436 aa  61.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2377  phage integrase family protein  28.25 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  32.58 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  32.58 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  32.58 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  32.17 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  31.47 
 
 		 402 aa  54.7  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  26.47 
 
 		 452 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  29.79 
 
 		 428 aa  51.2  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2271  hypothetical protein  25.29 
 
 		 337 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000219474  hitchhiker  0.000127881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2319  integrase family protein  26.54 
 
 		 493 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  40.82 
 
 		 412 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  27.48 
 
 		 426 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  29.03 
 
 		 412 aa  48.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  41.54 
 
 		 417 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  26.72 
 
 		 431 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01948  integrase  30.07 
 
 		 411 aa  45.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1356  phage integrase  27.12 
 
 		 388 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000418117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  40.35 
 
 		 402 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  29.77 
 
 		 430 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1611  integrase family protein  32.61 
 
 		 375 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.115349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2000  integrase family protein  29.77 
 
 		 430 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000276307  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  38.89 
 
 		 419 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  26.92 
 
 		 411 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  26.92 
 
 		 411 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  36.54 
 
 		 401 aa  41.6  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3235  Phage integrase  29.52 
 
 		 395 aa  41.6  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  26.92 
 
 		 411 aa  41.6  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>