More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03300 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  99.64 
 
 
281 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  97.09 
 
 
275 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  97.09 
 
 
275 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  97.45 
 
 
275 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  97.09 
 
 
275 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  97.09 
 
 
275 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  97.09 
 
 
275 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  96.28 
 
 
303 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  91.22 
 
 
272 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2313  transposase  73.59 
 
 
284 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.471731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  70.71 
 
 
281 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  72.66 
 
 
269 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  69.14 
 
 
429 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  67.04 
 
 
269 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  67.04 
 
 
269 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  67.04 
 
 
269 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  67.04 
 
 
269 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  67.04 
 
 
269 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  67.04 
 
 
269 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  67.04 
 
 
269 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2833  transposase and inactivated derivatives  62.96 
 
 
275 aa  362  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  50.18 
 
 
392 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  50.18 
 
 
392 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  50.18 
 
 
392 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0440  transposase  50.18 
 
 
289 aa  296  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  49.09 
 
 
290 aa  296  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  49.09 
 
 
290 aa  296  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  49.09 
 
 
290 aa  296  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  49.09 
 
 
290 aa  296  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  49.09 
 
 
290 aa  296  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  52.71 
 
 
301 aa  295  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  53.96 
 
 
279 aa  291  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0562  transposase  48.38 
 
 
278 aa  291  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  53.58 
 
 
279 aa  288  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3959  integrase catalytic subunit  52.09 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1001  integrase catalytic subunit  51.71 
 
 
276 aa  281  7.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.217899  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3841  integrase catalytic subunit  48.87 
 
 
277 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0276  integrase catalytic subunit  48.87 
 
 
277 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0738  integrase catalytic subunit  48.87 
 
 
277 aa  280  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  51.57 
 
 
270 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4089  integrase catalytic subunit  52.09 
 
 
276 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3980  integrase catalytic subunit  52.09 
 
 
276 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0796757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0646  integrase catalytic subunit  52.09 
 
 
276 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0407  integrase catalytic subunit  52.09 
 
 
276 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00647583  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  51.57 
 
 
270 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  51.57 
 
 
270 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  51.57 
 
 
270 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  51.57 
 
 
270 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  51.57 
 
 
270 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  52.36 
 
 
270 aa  278  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1609  integrase catalytic subunit  52.36 
 
 
270 aa  278  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3017  integrase catalytic subunit  52.36 
 
 
270 aa  278  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0866  integrase catalytic subunit  52.36 
 
 
270 aa  278  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0755  integrase catalytic subunit  52.36 
 
 
270 aa  278  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.377045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2051  integrase catalytic subunit  52.36 
 
 
270 aa  278  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4013  integrase catalytic subunit  52.36 
 
 
270 aa  278  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  52.36 
 
 
270 aa  278  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0685  integrase catalytic subunit  52.36 
 
 
270 aa  278  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  51.18 
 
 
270 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  51.18 
 
 
270 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  51.57 
 
 
270 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  51.18 
 
 
270 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  51.18 
 
 
270 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  52.16 
 
 
271 aa  275  5e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  52.16 
 
 
271 aa  275  5e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  52.16 
 
 
271 aa  275  5e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  54.27 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  54.27 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01677  hypothetical protein  52.97 
 
 
253 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  55.65 
 
 
244 aa  270  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  53.85 
 
 
248 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  53.85 
 
 
248 aa  268  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  53.42 
 
 
248 aa  266  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  46.99 
 
 
277 aa  262  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0652  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834926  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0988  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4608  integrase catalytic subunit  50.58 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1852  integrase catalytic subunit  50.22 
 
 
252 aa  252  6e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  45.74 
 
 
269 aa  231  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  45.74 
 
 
269 aa  231  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  45.74 
 
 
269 aa  231  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0460  integrase catalytic subunit  51.24 
 
 
203 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  58.86 
 
 
173 aa  206  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1889  IS911 transposase orfB  58.06 
 
 
179 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  41.73 
 
 
378 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  41.73 
 
 
378 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  41.73 
 
 
378 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  41.73 
 
 
378 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0093  integrase, putative  84.47 
 
 
104 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3229  transposase, truncation  84.47 
 
 
104 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  42.5 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  42.5 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  42.5 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  42.5 
 
 
293 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0234  integrase catalytic subunit  45.08 
 
 
195 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.100698 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  42.5 
 
 
293 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  39.64 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  39.64 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  39.64 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>