More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03290 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2389  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2526  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0599274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03290  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000165521  unclonable  4.74599e-22 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51620  transposase  100 
 
 
102 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141588  hitchhiker  0.0000324729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4698  hypothetical protein  99.02 
 
 
102 aa  203  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4228  hypothetical protein  99.02 
 
 
102 aa  203  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2835  hypothetical protein  98.04 
 
 
102 aa  201  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6037  hypothetical protein  86.27 
 
 
102 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4419  transposase, OrfA  78.43 
 
 
102 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000424248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4469  transposase IS3/IS911 family protein  74.51 
 
 
102 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4929  transposase IS3/IS911  74.51 
 
 
102 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3234  transposase IS3/IS911 family protein  74.51 
 
 
102 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4253  transposase IS3/IS911 family protein  73.53 
 
 
102 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0758  transposase IS3/IS911 family protein  76.77 
 
 
101 aa  156  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.462502  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2954  transposase IS3/IS911 family protein  76.77 
 
 
101 aa  156  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1762  transposase IS3/IS911 family protein  76.77 
 
 
101 aa  156  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1550  transposase IS3/IS911 family protein  76.77 
 
 
101 aa  156  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266897  hitchhiker  0.00000139324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3364  transposase IS3/IS911 family protein  76.77 
 
 
101 aa  156  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.430813 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  76.77 
 
 
101 aa  156  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00105094  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0627  transposase IS3/IS911 family protein  76.77 
 
 
101 aa  156  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000506319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2314  transposase  72.55 
 
 
102 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.397505 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2836  transposase IS3/IS911 family protein  67.65 
 
 
115 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2834  transposase and inactivated derivatives  64.58 
 
 
99 aa  134  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4695  ISPsy13, transposase OrfA  78.31 
 
 
83 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3829  transposase IS3/IS911 family protein  60.78 
 
 
102 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1853  transposase IS3/IS911  62.63 
 
 
100 aa  122  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1641  transposase IS3/IS911  58.82 
 
 
102 aa  121  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.783903  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1858  transposase IS3/IS911  58.82 
 
 
102 aa  121  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2075  transposase IS3/IS911  58.82 
 
 
102 aa  121  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01676  hypothetical protein  58.16 
 
 
103 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28850  hypothetical protein  88.24 
 
 
104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000267375  decreased coverage  0.000000000178046 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3329  IS911, transposase orfA  56.57 
 
 
100 aa  114  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0651  helix-turn-helix, Fis-type  62.38 
 
 
99 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0987  helix-turn-helix, Fis-type  62.38 
 
 
99 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4607  helix-turn-helix, Fis-type  62.38 
 
 
99 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4250  transposase IS3/IS911 family protein  55.45 
 
 
103 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233516 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2283  transposase IS3/IS911 family protein  55.45 
 
 
103 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.24244  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3109  IS911, transposase orfA  56.57 
 
 
100 aa  113  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4038  transposase IS3/IS911 family protein  55.45 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3313  transposase IS3/IS911 family protein  55.45 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4658  transposase IS3/IS911 family protein  55.45 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753244  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4292  transposase IS3/IS911 family protein  55.45 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4652  transposase IS3/IS911 family protein  55.45 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4415  transposase IS3/IS911 family protein  55.45 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0726  transposase IS3/IS911 family protein  55.45 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2336  transposase IS3/IS911 family protein  55.45 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0514936  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1348  transposase IS3/IS911 family protein  55.45 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1934  transposase IS3/IS911 family protein  55.45 
 
 
103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1695  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00957844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3019  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2598  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1768  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1237  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2605  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1667  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4925  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0068  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00561335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2734  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1637  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0129  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0225  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1301  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1561  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1594  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0303  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00845112  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0718  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.373976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0696  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4755  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0684  transposase IS3/IS911 family protein  54.46 
 
 
103 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0754  transposase IS3/IS911 family protein  54.46 
 
 
103 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.899394  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0865  transposase IS3/IS911 family protein  54.46 
 
 
103 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1610  transposase IS3/IS911 family protein  54.46 
 
 
103 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2050  transposase IS3/IS911 family protein  54.46 
 
 
103 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.575718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3016  transposase IS3/IS911 family protein  54.46 
 
 
103 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3144  transposase IS3/IS911 family protein  54.46 
 
 
103 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0609516  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3616  transposase IS3/IS911 family protein  54.46 
 
 
103 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4014  transposase IS3/IS911 family protein  54.46 
 
 
103 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0090  hypothetical protein  51 
 
 
103 aa  110  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386278  hitchhiker  0.00000000270737 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0090  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1687  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2307  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2161  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.03565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2274  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2514  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1387  transposase OrfAB, subunit A  56.7 
 
 
114 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0739  transposase OrfAB, subunit A  56.7 
 
 
114 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0441  transposase OrfAB, subunit A  56.7 
 
 
114 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2360  transposase OrfAB, subunit A  56.7 
 
 
114 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0731  transposase OrfAB, subunit A  56.7 
 
 
114 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3299  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4079  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1020  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0690  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0253  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.653907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4618  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.55073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4640  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1605  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000357192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1921  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  110  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0459  transposase IS3/IS911 family protein  54.46 
 
 
103 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1361  IS911, transposase orfA  55.56 
 
 
100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>