31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03200 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1250  hypothetical protein  93.56 
 
 
716 aa  1358  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03200  hypothetical protein  100 
 
 
716 aa  1474  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00162132  hitchhiker  2.40943e-12 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02463  hypothetical protein  32.66 
 
 
715 aa  305  2e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03643  hypothetical protein  31.72 
 
 
714 aa  296  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5055  hypothetical protein  35.82 
 
 
674 aa  293  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4519  hypothetical protein  31.89 
 
 
729 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3226  hypothetical protein  31.58 
 
 
728 aa  286  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2743  hypothetical protein  35.29 
 
 
674 aa  286  1e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.762938  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0090  hypothetical protein  31.79 
 
 
728 aa  283  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4081  hypothetical protein  33.72 
 
 
680 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.659789  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1614  hypothetical protein  31.8 
 
 
746 aa  282  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1584  hypothetical protein  30.95 
 
 
728 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287315  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0205  hypothetical protein  31.32 
 
 
728 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0144673  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0128  hypothetical protein  31.11 
 
 
746 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0101  Type V secretory pathway, adhesin AidA  31.23 
 
 
746 aa  270  6e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02459  hypothetical protein  31.48 
 
 
734 aa  259  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03639  hypothetical protein  30.62 
 
 
733 aa  253  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5511  hypothetical protein  29.88 
 
 
783 aa  138  3e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.333676  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3219  putative transmembrane protein  28.99 
 
 
731 aa  136  1e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0960  hypothetical protein  30.43 
 
 
746 aa  134  7e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.721372  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1942  hypothetical protein  31.55 
 
 
746 aa  132  2e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3648  hypothetical protein  28.23 
 
 
805 aa  130  7e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3324  hypothetical protein  28.13 
 
 
797 aa  130  9e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03018  hypothetical protein  30.26 
 
 
753 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.426915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5208  putative transmembrane protein  29.54 
 
 
770 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3370  putative transmembrane protein  30.58 
 
 
770 aa  123  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1695  Type V secretory pathway, adhesin AidA  27.4 
 
 
447 aa  122  2e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2253  hypothetical protein  27.59 
 
 
774 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1929  putative ribonuclease G and E  27.82 
 
 
774 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.384162  normal  0.037347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1687  putative ribonuclease G and E  27.9 
 
 
740 aa  113  1e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696506  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0094  hypothetical protein  24.22 
 
 
241 aa  66.2  2e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.88303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>