More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_02750 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_02750  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.549892  normal  0.0746214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0311  putative transcriptional regulator  97.77 
 
 		 179 aa  337  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1309  transcriptional regulator  74.86 
 
 		 180 aa  265  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2591  XRE family transcriptional regulator  70.56 
 
 		 180 aa  247  8e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2732  XRE family transcriptional regulator  71.11 
 
 		 180 aa  246  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3125  Cro/CI family transcriptional regulator  71.11 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  56.42 
 
 		 224 aa  205  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  56.35 
 
 		 187 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  56.35 
 
 		 187 aa  200  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  56.35 
 
 		 187 aa  200  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 180 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 180 aa  197  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  55.8 
 
 		 187 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  55.8 
 
 		 187 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  55.8 
 
 		 187 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  55.8 
 
 		 187 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 180 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  53.67 
 
 		 182 aa  189  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  45.4 
 
 		 180 aa  141  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 212 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.08 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  33.16 
 
 		 196 aa  94.4  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  32.37 
 
 		 184 aa  91.7  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 187 aa  91.3  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  31.82 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 190 aa  89  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 178 aa  88.6  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  32.7 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  32.7 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 187 aa  88.2  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  32.7 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  32.7 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  32.7 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  32.7 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 199 aa  88.2  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 190 aa  88.2  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  31.64 
 
 		 199 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 236 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  87.8  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 199 aa  87.8  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  31.79 
 
 		 186 aa  87.8  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 194 aa  87.8  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 199 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  31.75 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4442  DNA-binding protein  32.57 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4258  DNA-binding protein  32.57 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4094  transcriptional regulator  32.57 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4105  transcriptional regulator  32.57 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4590  DNA-binding protein  32.57 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4443  DNA-binding protein  32.57 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4493  DNA-binding protein  32.57 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 188 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 236 aa  85.9  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0755  DNA-binding protein  32 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4481  DNA-binding protein  32 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 192 aa  85.1  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 205 aa  85.1  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 192 aa  85.1  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 186 aa  84.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 193 aa  84  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  32.42 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3080  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.995144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  30.34 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2727  DNA-binding transcriptional regulator  30.65 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4448  XRE family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0311191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  29.48 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 292 aa  78.2  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05970  hypothetical protein  31.69 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>