More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_02250 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  90.2 
 
 
625 aa  1087    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  100 
 
 
639 aa  1264    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00412  probable two-component sensor (CheA)  46.85 
 
 
674 aa  561  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 
682 aa  560  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 
724 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  47.65 
 
 
662 aa  542  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  44.11 
 
 
671 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  43.71 
 
 
702 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  48.27 
 
 
655 aa  540  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
728 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  43.06 
 
 
724 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1046  CheA signal transduction histidine kinase  46.74 
 
 
684 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  45.22 
 
 
681 aa  535  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  46.61 
 
 
674 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  43.71 
 
 
704 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2093  CheA signal transduction histidine kinases  42.51 
 
 
736 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.768244 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1881  CheA signal transduction histidine kinases  42.51 
 
 
736 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0726  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  52.42 
 
 
784 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.550154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0655  CheA signal transduction histidine kinase  56.91 
 
 
732 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.666621 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
695 aa  482  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0182  CheA signal transduction histidine kinase  61.98 
 
 
743 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0165  CheA signal transduction histidine kinase  61.72 
 
 
761 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.690811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1624  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  60.96 
 
 
691 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.885628  normal  0.805041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0585  chemotaxis protein histidine kinase  56.35 
 
 
719 aa  479  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.648466  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0169  CheA signal transduction histidine kinases  61.98 
 
 
744 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3358  CheA signal transduction histidine kinase  62.11 
 
 
749 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.701672  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0567  CheA signal transduction histidine kinases  53.4 
 
 
729 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176437  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  56.85 
 
 
783 aa  478  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2851  CheA signal transduction histidine kinases  61.46 
 
 
756 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0256  CheA signal transduction histidine kinases  61.46 
 
 
756 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.228038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0238  CheA signal transduction histidine kinase  61.46 
 
 
750 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119172  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2859  chemotaxis protein CheA  59.16 
 
 
767 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5608  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  59.49 
 
 
673 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3116  chemotaxis protein CheA  59.16 
 
 
767 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2974  CheA signal transduction histidine kinase  60.42 
 
 
772 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131554 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1684  chemotaxis protein CheA  59.16 
 
 
767 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.41407  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3435  chemotaxis protein CheA  59.16 
 
 
767 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
677 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3182  chemotaxis protein CheA  60.53 
 
 
749 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.671944  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4048  CheA signal transduction histidine kinase  61.68 
 
 
724 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.507068  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4160  CheA signal transduction histidine kinase  61.68 
 
 
724 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158924  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3815  CheA signal transduction histidine kinase  60.1 
 
 
766 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0077  chemotaxis protein CheA  60.79 
 
 
765 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  58.89 
 
 
669 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3936  chemotaxis protein CheA  60.79 
 
 
765 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3855  chemotaxis protein CheA  60.79 
 
 
762 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4156  CheA signal transduction histidine kinase  59.48 
 
 
684 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.847585  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4378  CheA signal transduction histidine kinase  55.02 
 
 
725 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1408  chemotaxis sensor histidine kinase transcription regulator protein  60.89 
 
 
726 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.146245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0119  CheA Signal transduction histidine Kinases(STHK)  59.38 
 
 
766 aa  465  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  56.8 
 
 
654 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  56.8 
 
 
654 aa  456  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  60.26 
 
 
669 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  56.8 
 
 
654 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  60.26 
 
 
669 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3689  CheA signal transduction histidine kinase  58.25 
 
 
671 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.296916  normal  0.0151662 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  56.8 
 
 
652 aa  455  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3064  CheA signal transduction histidine kinase  54.02 
 
 
710 aa  458  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3790  CheA signal transduction histidine kinases  54.02 
 
 
710 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1200  chemotaxis protein CheA  60 
 
 
669 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.485544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  56.8 
 
 
654 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2077  chemotaxis protein CheA  60 
 
 
669 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  hitchhiker  0.0000338271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1599  CheA signal transduction histidine kinase  52.74 
 
 
722 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193702 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1749  chemotaxis protein CheA  58.1 
 
 
727 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.656307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1638  chemotaxis protein CheA  56.35 
 
 
717 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  51.27 
 
 
715 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  60 
 
 
669 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  56.8 
 
 
652 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  56.8 
 
 
654 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  56.56 
 
 
654 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  56.8 
 
 
654 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  57.84 
 
 
758 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2825  chemotaxis protein CheA  56.12 
 
 
717 aa  452  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.286152 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 
694 aa  451  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1540  chemotaxis protein CheA  58.9 
 
 
672 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0565086  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0156  chemotaxis protein CheA  60.16 
 
 
747 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.93752  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2169  CheA signal transduction histidine kinase  54.23 
 
 
707 aa  445  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24340  Chemotaxis sensory histidine protein kinase; CheA  56.46 
 
 
697 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3215  CheA signal transduction histidine kinase  57.77 
 
 
684 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.647718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  53.66 
 
 
806 aa  435  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  51.53 
 
 
686 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  48.97 
 
 
688 aa  405  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  46.41 
 
 
720 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2167  CheA signal transduction histidine kinases  47.79 
 
 
703 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0949772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0611  CheA signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
683 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.527763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2143  chemotaxis protein cheA  52.32 
 
 
684 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2112  CheA signal transduction histidine kinase  58.31 
 
 
565 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  35.96 
 
 
677 aa  382  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  36.32 
 
 
770 aa  380  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  36.41 
 
 
769 aa  379  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  35.94 
 
 
769 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  39.09 
 
 
887 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  36.19 
 
 
769 aa  375  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3623  CheA signal transduction histidine kinase  50.77 
 
 
747 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0124085 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
770 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
871 aa  372  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.84 
 
 
803 aa  372  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  36.79 
 
 
774 aa  372  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0279  CheA signal transduction histidine kinase  51.13 
 
 
751 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597552  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  36.07 
 
 
783 aa  368  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>