48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01180 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  94.32 
 
 
370 aa  713  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  807  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  69.57 
 
 
370 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  47.88 
 
 
373 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  39.61 
 
 
366 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3112  hypothetical protein  40.47 
 
 
340 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192331  normal  0.139244 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3467  hypothetical protein  39.88 
 
 
340 aa  214  2e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  31.76 
 
 
335 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3869  hypothetical protein  28.5 
 
 
438 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0106797  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2438  Protein of unknown function DUF2169  29.58 
 
 
383 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  30.56 
 
 
337 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2128  hypothetical protein  27.92 
 
 
438 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.469876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  31.88 
 
 
357 aa  132  1e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7055  hypothetical protein  30.86 
 
 
356 aa  128  1e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0582367  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  30.03 
 
 
373 aa  122  1e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.25532e-06 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  33.54 
 
 
356 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000445  pentapeptide repeat family protein  27.94 
 
 
330 aa  118  2e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05867  hypothetical protein  27.93 
 
 
330 aa  118  2e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4428  hypothetical protein  27.32 
 
 
445 aa  115  1e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3387  hypothetical protein  27.03 
 
 
338 aa  111  2e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128743  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7560  hypothetical protein  28.06 
 
 
348 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1192  hypothetical protein  26.7 
 
 
447 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3484  hypothetical protein  29.57 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2738  hypothetical protein  31.43 
 
 
383 aa  91.3  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  29.58 
 
 
949 aa  85.5  2e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2827  hypothetical protein  28.61 
 
 
352 aa  79.7  7e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6142  hypothetical protein  34.15 
 
 
192 aa  76.3  9e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  25.77 
 
 
976 aa  70.5  5e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  32.3 
 
 
825 aa  67.8  3e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  32.3 
 
 
862 aa  67.8  3e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  29.03 
 
 
846 aa  67.8  3e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  32.3 
 
 
825 aa  67.8  4e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  32.3 
 
 
825 aa  67.8  4e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  32.3 
 
 
825 aa  67.8  4e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  32.3 
 
 
825 aa  67.8  4e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  32.3 
 
 
825 aa  67.8  4e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.9 
 
 
872 aa  67  5e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  29.14 
 
 
844 aa  63.9  5e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3786  hypothetical protein  27.46 
 
 
343 aa  62  2e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3016  hypothetical protein  30.67 
 
 
320 aa  58.9  2e-07  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  31.44 
 
 
870 aa  58.2  3e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  28.33 
 
 
881 aa  57.4  4e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  27.39 
 
 
866 aa  53.5  6e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  27.03 
 
 
886 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  25.68 
 
 
739 aa  43.9  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  25.68 
 
 
739 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  25.68 
 
 
739 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0930  hypothetical protein  26.36 
 
 
338 aa  43.5  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0087813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>