More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2632  ATPase AAA-2  59.31 
 
 
681 aa  768  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  57.21 
 
 
889 aa  962  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  51.83 
 
 
887 aa  887  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  53.35 
 
 
889 aa  880  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  54.19 
 
 
895 aa  908  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  53.35 
 
 
889 aa  880  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  54.19 
 
 
895 aa  910  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.49 
 
 
888 aa  1015  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.38 
 
 
884 aa  1008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  53.35 
 
 
889 aa  880  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  53.08 
 
 
879 aa  890  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  52.96 
 
 
879 aa  890  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  45.93 
 
 
866 aa  679  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  88.86 
 
 
900 aa  1573  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0021  clpB protein  43.03 
 
 
869 aa  661  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  53.8 
 
 
882 aa  880  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  51.16 
 
 
910 aa  844  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  53.35 
 
 
889 aa  880  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.27 
 
 
884 aa  1006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  57.65 
 
 
904 aa  979  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0237  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.04 
 
 
923 aa  645  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  48.05 
 
 
868 aa  805  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1177  chaperone ClpB-1  43.6 
 
 
872 aa  734  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  53.71 
 
 
889 aa  870  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  55.01 
 
 
897 aa  920  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  100 
 
 
902 aa  1821  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33990  putative ClpA/B-type protease  49.94 
 
 
849 aa  736  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.6123e-06  normal  0.0826946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  44.98 
 
 
877 aa  684  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  53.66 
 
 
889 aa  874  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  53.48 
 
 
889 aa  858  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  53.08 
 
 
879 aa  891  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  56.99 
 
 
915 aa  930  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  43.88 
 
 
895 aa  733  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.27 
 
 
884 aa  1007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  52.87 
 
 
897 aa  874  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  50.73 
 
 
865 aa  828  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  69.86 
 
 
901 aa  1177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  44.31 
 
 
881 aa  686  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  43.69 
 
 
884 aa  711  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  61.9 
 
 
887 aa  1071  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  53.66 
 
 
889 aa  874  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2520  type VI secretion ATPase  42.79 
 
 
863 aa  690  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  42.92 
 
 
884 aa  668  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  61.44 
 
 
928 aa  1065  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  51.06 
 
 
865 aa  850  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  52.75 
 
 
889 aa  864  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  55.38 
 
 
893 aa  911  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  43.96 
 
 
882 aa  680  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  9.64396e-05 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  53.53 
 
 
891 aa  931  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  43.73 
 
 
880 aa  683  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  51.4 
 
 
865 aa  842  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3559  type VI secretion ATPase  44.42 
 
 
862 aa  712  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  53.64 
 
 
885 aa  937  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  75.85 
 
 
916 aa  1343  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.02411e-09 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0231  ATP-dependent chaperone protein ClpB  42.12 
 
 
919 aa  643  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  54.21 
 
 
906 aa  912  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1205  ATPase  41.99 
 
 
873 aa  672  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  98.67 
 
 
902 aa  1802  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  50.06 
 
 
849 aa  746  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  44.11 
 
 
875 aa  679  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  52.08 
 
 
891 aa  858  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  54.24 
 
 
906 aa  919  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  43.62 
 
 
882 aa  676  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  51.17 
 
 
909 aa  843  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  44.18 
 
 
880 aa  684  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  55.91 
 
 
889 aa  925  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3430  AAA family ATPase  44.42 
 
 
867 aa  713  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  44.2 
 
 
902 aa  690  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  54.2 
 
 
887 aa  909  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  44.64 
 
 
894 aa  721  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0229  type VI secretion ATPase  41.83 
 
 
923 aa  642  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  43.61 
 
 
880 aa  680  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  56.8 
 
 
903 aa  966  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  46.81 
 
 
878 aa  681  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2798  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.22 
 
 
872 aa  665  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.425597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  49.06 
 
 
846 aa  736  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  54.19 
 
 
918 aa  908  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  58.49 
 
 
888 aa  1018  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1079  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  41.07 
 
 
865 aa  635  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0505801  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2449  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  60.39 
 
 
869 aa  1044  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000027  ClpB protein  45.68 
 
 
855 aa  732  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  45.24 
 
 
913 aa  709  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  44.66 
 
 
885 aa  700  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  53.64 
 
 
885 aa  937  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  46.2 
 
 
899 aa  697  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  53.35 
 
 
889 aa  880  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  58.09 
 
 
887 aa  1001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  53.98 
 
 
893 aa  911  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  54.88 
 
 
918 aa  914  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  58.05 
 
 
885 aa  1003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3246  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  41.18 
 
 
865 aa  644  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  53.65 
 
 
887 aa  873  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  52.8 
 
 
889 aa  878  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000450  ClpB protein  50.3 
 
 
687 aa  636  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  46.79 
 
 
897 aa  792  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  45.07 
 
 
893 aa  709  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  59.8 
 
 
886 aa  1021  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  58.49 
 
 
888 aa  1016  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  52.87 
 
 
897 aa  874  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2548  clpB protein, putative  41.36 
 
 
867 aa  652  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>