154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01080 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  707  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  98.28 
 
 
348 aa  697  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  72.21 
 
 
328 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  44.24 
 
 
336 aa  269  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  44.2 
 
 
366 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  48.5 
 
 
388 aa  259  5e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  45.65 
 
 
367 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  45.2 
 
 
388 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  41.62 
 
 
359 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  45.54 
 
 
377 aa  254  2e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91474e-09 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  44.09 
 
 
349 aa  249  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  46.3 
 
 
427 aa  245  1e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  44.03 
 
 
337 aa  244  2e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  41.46 
 
 
357 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  42.5 
 
 
357 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  41.72 
 
 
353 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  39.87 
 
 
362 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  43.69 
 
 
361 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  39.8 
 
 
370 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  41.85 
 
 
488 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  41.13 
 
 
492 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  41.16 
 
 
349 aa  222  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  39.2 
 
 
351 aa  222  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  42.72 
 
 
361 aa  221  1e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  41.14 
 
 
358 aa  221  1e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  42.72 
 
 
361 aa  221  1e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  42.72 
 
 
361 aa  221  1e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  41.42 
 
 
353 aa  221  2e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  40.59 
 
 
481 aa  219  4e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  42.72 
 
 
361 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  42.72 
 
 
361 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  42.72 
 
 
361 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  40.84 
 
 
349 aa  219  8e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  40.84 
 
 
349 aa  219  8e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  40.84 
 
 
349 aa  219  8e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  39.47 
 
 
346 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  40.84 
 
 
358 aa  209  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  38.82 
 
 
349 aa  206  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  40.39 
 
 
385 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  38.66 
 
 
331 aa  196  4e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  38.66 
 
 
331 aa  196  4e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  37.5 
 
 
331 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  38.61 
 
 
311 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  37.58 
 
 
352 aa  182  9e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  37.7 
 
 
341 aa  180  3e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  37.38 
 
 
341 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  37.38 
 
 
341 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  33.54 
 
 
356 aa  162  8e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  32.3 
 
 
356 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  32.72 
 
 
356 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  33.84 
 
 
356 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  33.84 
 
 
356 aa  156  5e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.75 
 
 
343 aa  148  1e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  31.25 
 
 
329 aa  147  2e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  35.38 
 
 
345 aa  146  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.1 
 
 
344 aa  142  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  31.66 
 
 
363 aa  140  5e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  29.65 
 
 
354 aa  133  4e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  33.13 
 
 
364 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  34.95 
 
 
341 aa  132  7e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  30.67 
 
 
330 aa  132  8e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  30.23 
 
 
335 aa  131  2e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  48.82 
 
 
492 aa  129  5e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  48.82 
 
 
492 aa  129  5e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  29.97 
 
 
363 aa  130  5e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  48.82 
 
 
492 aa  129  5e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  48.82 
 
 
456 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  35.61 
 
 
366 aa  129  7e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  35.61 
 
 
366 aa  129  7e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  35.61 
 
 
366 aa  129  7e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  35.61 
 
 
366 aa  129  7e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  35.61 
 
 
366 aa  129  7e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  35.61 
 
 
366 aa  129  7e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  35.61 
 
 
366 aa  129  7e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  32.52 
 
 
366 aa  128  1e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  33.63 
 
 
366 aa  127  4e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  35.95 
 
 
366 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  35.83 
 
 
338 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  36.36 
 
 
366 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  35.83 
 
 
366 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  36.36 
 
 
366 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  33.23 
 
 
366 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  36.63 
 
 
338 aa  121  1e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3126  hypothetical protein  31.63 
 
 
332 aa  121  1e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0272952  normal  0.0855936 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  28.32 
 
 
337 aa  122  1e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3482  hypothetical protein  31.95 
 
 
332 aa  122  1e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  31.42 
 
 
369 aa  120  2e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  36.63 
 
 
338 aa  121  2e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0758  hypothetical protein  28.08 
 
 
327 aa  118  2e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.300158  normal  0.0515134 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3560  type VI secretion protein  28.08 
 
 
327 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3431  hypothetical protein  28.08 
 
 
327 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  25.69 
 
 
332 aa  117  4e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  27.3 
 
 
343 aa  116  7e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  30.86 
 
 
356 aa  115  9e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.52 
 
 
332 aa  115  1e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  25.6 
 
 
332 aa  115  1e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  35.22 
 
 
328 aa  115  1e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.16 
 
 
332 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  28.44 
 
 
317 aa  113  4e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  35.25 
 
 
330 aa  112  9e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>