175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  53.44 
 
 
625 aa  662  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  98.38 
 
 
619 aa  1234  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  100 
 
 
619 aa  1254  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  83.04 
 
 
619 aa  1061  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  48.48 
 
 
623 aa  582  1e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  50.08 
 
 
620 aa  575  1e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  48.03 
 
 
630 aa  564  1e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  48.96 
 
 
624 aa  560  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  47.37 
 
 
623 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  47.53 
 
 
624 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  47.37 
 
 
623 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  47.37 
 
 
623 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  47.37 
 
 
623 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  47.21 
 
 
623 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  47.21 
 
 
623 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  47.37 
 
 
623 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  46.89 
 
 
623 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  47.21 
 
 
623 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  45.95 
 
 
628 aa  537  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  46.96 
 
 
638 aa  521  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.36966e-08 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  45.21 
 
 
624 aa  521  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  44.59 
 
 
626 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  43.17 
 
 
629 aa  493  1e-138  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  43.22 
 
 
626 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  43.22 
 
 
626 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  43.22 
 
 
626 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  42.9 
 
 
626 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  43.02 
 
 
629 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  44.3 
 
 
629 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  44.3 
 
 
629 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  44.3 
 
 
629 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  44.3 
 
 
629 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  44.3 
 
 
629 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  44.3 
 
 
629 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  44.3 
 
 
629 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  43.97 
 
 
626 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  41.95 
 
 
626 aa  480  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  42.7 
 
 
630 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  41.95 
 
 
626 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  41.95 
 
 
626 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  42.59 
 
 
629 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  43.49 
 
 
626 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  42.11 
 
 
629 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  41.49 
 
 
627 aa  454  1e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  41.18 
 
 
627 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  40.73 
 
 
629 aa  452  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  41.34 
 
 
627 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  40.63 
 
 
629 aa  435  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  40.54 
 
 
654 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  38.5 
 
 
652 aa  417  1e-115  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  39.08 
 
 
639 aa  409  1e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  39.07 
 
 
628 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  39.17 
 
 
647 aa  392  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  35.74 
 
 
633 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  35.08 
 
 
637 aa  364  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.38 
 
 
642 aa  355  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  34.88 
 
 
610 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  38.56 
 
 
605 aa  348  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  34.76 
 
 
611 aa  340  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.48 
 
 
590 aa  338  2e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  34.49 
 
 
606 aa  337  3e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  34.34 
 
 
606 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.36 
 
 
590 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  34.34 
 
 
606 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  34.07 
 
 
606 aa  328  1e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  31.65 
 
 
609 aa  313  7e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  35.6 
 
 
620 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  35.68 
 
 
621 aa  304  3e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  35.68 
 
 
621 aa  300  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  33.44 
 
 
589 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.19 
 
 
612 aa  298  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  34.19 
 
 
611 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  34.19 
 
 
611 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  34.19 
 
 
611 aa  296  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  34.03 
 
 
611 aa  294  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  34.03 
 
 
611 aa  294  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  34.03 
 
 
611 aa  294  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  33.82 
 
 
586 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  31.98 
 
 
641 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  5.54833e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  33.39 
 
 
611 aa  287  3e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  34.31 
 
 
611 aa  283  8e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  34.24 
 
 
597 aa  280  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  33.49 
 
 
616 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  34.08 
 
 
597 aa  277  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  34.39 
 
 
612 aa  276  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  34.24 
 
 
612 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  34.24 
 
 
612 aa  275  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  34.24 
 
 
612 aa  275  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  34.71 
 
 
593 aa  273  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  34.08 
 
 
612 aa  273  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  34.08 
 
 
612 aa  273  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  32.85 
 
 
589 aa  271  3e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  29.7 
 
 
607 aa  270  8e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  31.9 
 
 
610 aa  266  6e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  32.64 
 
 
592 aa  263  5e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  32.79 
 
 
597 aa  253  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  32.7 
 
 
587 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  30.3 
 
 
588 aa  236  1e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  30.46 
 
 
588 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  30.13 
 
 
588 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  1.24343e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>