41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01040 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_01040  putative secretion protein  100 
 
 
281 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0158  virulence protein, SciE type  96.17 
 
 
261 aa  497  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2327  virulence protein, SciE type  74.61 
 
 
261 aa  394  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0365801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0525  virulence protein SciE type  52.9 
 
 
278 aa  268  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3856  virulence protein SciE type  45.17 
 
 
269 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271888  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1478  virulence protein, SciE type  45.38 
 
 
285 aa  216  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00263  ImpE protein  40.78 
 
 
277 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0977  virulence protein, SciE type  39.45 
 
 
284 aa  172  8e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6117  virulence protein SciE type  38.11 
 
 
288 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  0.445465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1686  virulence protein SciE type  38.74 
 
 
275 aa  166  3e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.207214  normal  0.113631 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3010  virulence protein SciE type  40.75 
 
 
284 aa  165  7e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177005  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3009  virulence protein SciE type  38.64 
 
 
271 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3471  virulence protein, SciE type  37.02 
 
 
283 aa  162  8e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1931  hypothetical protein  37.79 
 
 
268 aa  161  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.350891  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1377  ImpE family protein  37.79 
 
 
268 aa  161  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1489  virulence protein SciE type  37.79 
 
 
268 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747548  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0944  virulence protein SciE type  36.51 
 
 
290 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0293  SciE protein  36.05 
 
 
274 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.816472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0300  SciE protein  36.05 
 
 
274 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0295  SciE protein  36.05 
 
 
274 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.227917 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0308  hypothetical protein  35.66 
 
 
274 aa  155  5e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.914397 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0174  ImpE/SciE family protein  37.89 
 
 
268 aa  153  3e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1623  SciE protein  37.89 
 
 
284 aa  153  3e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0152  ImpE/SciE family protein  37.89 
 
 
268 aa  153  3e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0138  ImpE protein superfamily protein  37.45 
 
 
284 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0196  virulence protein SciE type  34.06 
 
 
288 aa  147  1e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6691  virulence protein SciE type  38.08 
 
 
286 aa  148  1e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2453  virulence protein SciE type  33.83 
 
 
275 aa  146  4e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0337  ImpE/SciE family protein  36.19 
 
 
321 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0246  ImpE/SciE family protein  35.8 
 
 
321 aa  141  1e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1698  ImpE protein superfamily protein  35.8 
 
 
321 aa  141  1e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1906  hypothetical protein  35.8 
 
 
321 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0917  hypothetical protein  35.8 
 
 
321 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1204  hypothetical protein  35.8 
 
 
321 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2179  ImpE/SciE family protein  35.8 
 
 
321 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3074  virulence protein, SciE type  33.33 
 
 
271 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1532  hypothetical protein  31.56 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000023  protein of avirulence locus ImpE  26.8 
 
 
264 aa  84  2e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.692484  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2366  virulence protein, SciE type  22.93 
 
 
262 aa  68.9  8e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6048  hypothetical protein  27.99 
 
 
275 aa  61.6  1e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3028  virulence protein, SciE type  29.36 
 
 
265 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0281455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>