133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01030 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  333  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  99.38 
 
 
162 aa  333  6e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  85.19 
 
 
162 aa  255  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  64.78 
 
 
161 aa  170  6e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25402e-09 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  55.35 
 
 
160 aa  165  3e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  50.92 
 
 
160 aa  158  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  48.15 
 
 
160 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  151  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  44.38 
 
 
160 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  45 
 
 
160 aa  144  7e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  45.62 
 
 
161 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  45.62 
 
 
161 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  43.75 
 
 
160 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  48.75 
 
 
160 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  43.75 
 
 
160 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  45.62 
 
 
161 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  45.62 
 
 
161 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  45.62 
 
 
161 aa  139  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  45.62 
 
 
161 aa  139  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  54.05 
 
 
166 aa  137  5e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  46.63 
 
 
161 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  44.38 
 
 
161 aa  137  9e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  47.53 
 
 
160 aa  135  3e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00264  hypothetical protein  44.51 
 
 
167 aa  132  1e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  45.62 
 
 
161 aa  131  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  41.36 
 
 
160 aa  129  2e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  46.91 
 
 
160 aa  126  1e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  45.4 
 
 
161 aa  125  2e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  45.4 
 
 
161 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  45.4 
 
 
161 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  45.4 
 
 
161 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  45.4 
 
 
161 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  45.4 
 
 
161 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  45.4 
 
 
161 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  46.54 
 
 
160 aa  124  4e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  45.62 
 
 
161 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  49.08 
 
 
161 aa  121  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  41.72 
 
 
161 aa  120  1e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  41.72 
 
 
161 aa  120  1e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  41.72 
 
 
189 aa  120  1e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  45.68 
 
 
160 aa  119  2e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  45.4 
 
 
161 aa  119  2e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  46.01 
 
 
161 aa  119  2e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  40.13 
 
 
155 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  39.63 
 
 
163 aa  116  1e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  39.63 
 
 
163 aa  116  1e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  39.63 
 
 
163 aa  116  1e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  39.63 
 
 
163 aa  116  1e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  39.63 
 
 
163 aa  116  1e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  39.63 
 
 
163 aa  116  1e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  39.63 
 
 
163 aa  116  1e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  45.22 
 
 
157 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5375  protein of unknown function DUF796  45.91 
 
 
158 aa  114  4e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330014  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1237  hypothetical protein  45.91 
 
 
158 aa  113  8e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  39.63 
 
 
163 aa  113  9e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  38.41 
 
 
163 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0195  protein of unknown function DUF796  40.74 
 
 
160 aa  111  4e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3837  hypothetical protein  38.27 
 
 
160 aa  107  8e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0274684  normal  0.040602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0741  hemolysin-coregulated protein (uncharacterized)-like protein  36.11 
 
 
176 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  35.67 
 
 
163 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  35.67 
 
 
163 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  39.58 
 
 
166 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  33.75 
 
 
160 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  38.92 
 
 
172 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  38.92 
 
 
172 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  38.92 
 
 
172 aa  100  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3341  hypothetical protein  40.88 
 
 
160 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.183081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.54 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  34.39 
 
 
164 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0702  hypothetical protein  36.09 
 
 
175 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0791  hypothetical protein  36.09 
 
 
175 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2076  hypothetical protein  36.09 
 
 
175 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1899  hypothetical protein  36.09 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1042  hypothetical protein  35.5 
 
 
175 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0440  hypothetical protein  35.5 
 
 
175 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2016  hypothetical protein  35.5 
 
 
175 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0747  hypothetical protein  35.5 
 
 
175 aa  94  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  34.76 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  32.93 
 
 
165 aa  91.3  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  32.95 
 
 
176 aa  90.9  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  33.97 
 
 
162 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  34.91 
 
 
172 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  34.91 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  32.9 
 
 
165 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1731  hypothetical protein  30.63 
 
 
160 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0163556  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  34.32 
 
 
172 aa  84  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  34.32 
 
 
180 aa  84  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4088  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.1 
 
 
174 aa  82  3e-15  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45431e-09 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  31.21 
 
 
181 aa  81.3  6e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  31.21 
 
 
162 aa  80.1  1e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  28.57 
 
 
165 aa  79  2e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.8 
 
 
162 aa  78.2  5e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.8 
 
 
162 aa  77.8  6e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4915  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.21 
 
 
167 aa  77.8  6e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00101993  hitchhiker  0.00306602 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  30.82 
 
 
165 aa  77.4  8e-14  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2175  hypothetical protein  31.21 
 
 
178 aa  76.3  2e-13  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000201065  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4039  hypothetical protein  33.54 
 
 
162 aa  76.3  2e-13  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999117  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_003296  RS01963  hypothetical protein  32.3 
 
 
167 aa  75.5  3e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229622  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1537  histidine kinase  33.13 
 
 
162 aa  75.5  3e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5980  hypothetical protein  27.67 
 
 
162 aa  74.3  6e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>