154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01010 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_01010  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  346  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0155  hypothetical protein  98.84 
 
 
172 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2322  hypothetical protein  94.61 
 
 
171 aa  319  1e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239725  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4091  type VI secretion protein  78.88 
 
 
168 aa  266  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.40512e-07 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1605  hypothetical protein  75.15 
 
 
179 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0133  hypothetical protein  75.15 
 
 
179 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0157  hypothetical protein  75.15 
 
 
179 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1683  type VI secretion protein, VC_A0107 family  75.3 
 
 
179 aa  262  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0225402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0550  type VI secretion protein, VC_A0107 family  76.69 
 
 
172 aa  261  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1367  hypothetical protein  73.56 
 
 
174 aa  260  5e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.466171  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1479  type VI secretion protein  73.56 
 
 
174 aa  260  5e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.276644  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3028  type VI secretion protein  73.49 
 
 
178 aa  260  5e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2871  hypothetical protein  73.56 
 
 
174 aa  260  5e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1476  hypothetical protein  75.32 
 
 
182 aa  259  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6673  type VI secretion protein  73.49 
 
 
185 aa  258  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72757  normal  0.388479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0941  type VI secretion protein, VC_A0107 family  73.49 
 
 
181 aa  258  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3003  hypothetical protein  72.84 
 
 
178 aa  258  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3850  type VI secretion protein  74.68 
 
 
180 aa  256  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453706  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6114  type VI secretion protein  69.19 
 
 
177 aa  254  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2461  type VI secretion protein, VC_A0107 family  72.62 
 
 
176 aa  254  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0121  hypothetical protein  75 
 
 
179 aa  252  1e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3474  hypothetical protein  70.66 
 
 
180 aa  253  1e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279026  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0980  hypothetical protein  69.64 
 
 
179 aa  251  4e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0305  type VI secretion protein, family  70.91 
 
 
180 aa  248  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0311  type VI secretion protein, family  70.91 
 
 
180 aa  248  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0243  hypothetical protein  69.88 
 
 
193 aa  248  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0871713  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0334  hypothetical protein  69.88 
 
 
193 aa  248  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3907  type VI secretion protein  68.45 
 
 
179 aa  246  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0299  type VI secretion protein  70.73 
 
 
180 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506089  normal  0.154697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0296  hypothetical protein  70.73 
 
 
180 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.822214 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0921  hypothetical protein  69.28 
 
 
193 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1208  hypothetical protein  69.28 
 
 
193 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  69.28 
 
 
182 aa  244  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2183  hypothetical protein  69.28 
 
 
193 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.945386  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1909  hypothetical protein  69.28 
 
 
193 aa  245  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1695  hypothetical protein  71.07 
 
 
1238 aa  243  1e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2835  hypothetical protein  69.46 
 
 
192 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0193  type VI secretion protein, VC_A0107 family  67.7 
 
 
189 aa  241  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1200  hypothetical protein  69.46 
 
 
192 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2960  hypothetical protein  69.46 
 
 
192 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26670  hypothetical protein (UCP028301)  67.92 
 
 
188 aa  239  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0258  hypothetical protein  69.57 
 
 
193 aa  239  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1600  hypothetical protein  68.86 
 
 
192 aa  238  3e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1588  hypothetical protein  71.07 
 
 
184 aa  238  3e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149001  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1783  hypothetical protein  68.86 
 
 
192 aa  238  3e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0453  hypothetical protein  68.86 
 
 
192 aa  238  3e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0403  hypothetical protein  68.86 
 
 
192 aa  238  3e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3436  hypothetical protein  59.88 
 
 
186 aa  201  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00868528  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0763  hypothetical protein  59.88 
 
 
186 aa  201  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.184659  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3565  type VI secretion protein  59.88 
 
 
186 aa  201  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00266  hypothetical protein  63.76 
 
 
150 aa  197  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  53.46 
 
 
183 aa  178  3e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0789  hypothetical protein  56.08 
 
 
182 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0700  hypothetical protein  56.08 
 
 
182 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2018  type VI secretion protein  56.08 
 
 
182 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2074  hypothetical protein  56.08 
 
 
182 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.385689  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2360  type VI secretion protein, VC_A0107 family  54.37 
 
 
183 aa  163  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3041  type VI secretion protein, VC_A0107 family  51.43 
 
 
178 aa  161  4e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  42.29 
 
 
177 aa  144  4e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  43.03 
 
 
176 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  41.77 
 
 
190 aa  141  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  41.82 
 
 
176 aa  139  1e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  42.59 
 
 
177 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2443  hypothetical protein  46.02 
 
 
180 aa  137  5e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.485859  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3121  hypothetical protein  46.55 
 
 
176 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241786  normal  0.0428701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  42.59 
 
 
177 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  41.51 
 
 
182 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3477  hypothetical protein  46.55 
 
 
176 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  42.24 
 
 
179 aa  135  3e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  42.24 
 
 
191 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  42.24 
 
 
179 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  42.41 
 
 
180 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  43.67 
 
 
167 aa  131  4e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2177  hypothetical protein  41.67 
 
 
170 aa  130  8e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.4001e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  40.37 
 
 
166 aa  130  1e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  43.56 
 
 
171 aa  129  2e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  42.86 
 
 
170 aa  129  2e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  40.51 
 
 
187 aa  128  4e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  42.94 
 
 
171 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  42.94 
 
 
171 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  42.94 
 
 
171 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  42.94 
 
 
171 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  42.33 
 
 
171 aa  126  2e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  42.33 
 
 
171 aa  126  2e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  1.94603e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  42.24 
 
 
182 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  4.68167e-08  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  42.04 
 
 
176 aa  124  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  38.06 
 
 
181 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  38.06 
 
 
181 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  39.88 
 
 
172 aa  119  2e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  39.88 
 
 
172 aa  119  2e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  39.88 
 
 
172 aa  119  2e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  39.88 
 
 
172 aa  119  2e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  41.06 
 
 
167 aa  116  2e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0438  hypothetical protein  49.56 
 
 
141 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874563  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  37.11 
 
 
168 aa  115  4e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  36.59 
 
 
171 aa  113  1e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  38.41 
 
 
166 aa  113  2e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  35.44 
 
 
169 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5266  hypothetical protein  35.66 
 
 
168 aa  82.8  2e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  35.34 
 
 
175 aa  82.4  3e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>