110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00990 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  665  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  90.7 
 
 
343 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  62.82 
 
 
340 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  40.23 
 
 
343 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  34.72 
 
 
341 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  36.97 
 
 
345 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.85022e-07 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  36.92 
 
 
342 aa  165  1e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  33.71 
 
 
346 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  33.72 
 
 
339 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  35.67 
 
 
345 aa  148  2e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  38.57 
 
 
371 aa  145  7e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  28.92 
 
 
363 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  52.42 
 
 
354 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  30.9 
 
 
361 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  31.64 
 
 
361 aa  114  2e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.43 
 
 
360 aa  114  2e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  48.8 
 
 
344 aa  112  1e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  31.58 
 
 
372 aa  108  9e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  31.4 
 
 
365 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  31.27 
 
 
347 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  28.25 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  28.25 
 
 
356 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  28.25 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  29.13 
 
 
356 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  31.44 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  30.9 
 
 
372 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  31.44 
 
 
349 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  27.51 
 
 
354 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  31.44 
 
 
349 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  30.12 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  28.98 
 
 
366 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  29.89 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2358  hypothetical protein  28.73 
 
 
441 aa  87.4  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0645311 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  28.87 
 
 
352 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  29.71 
 
 
366 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  25.5 
 
 
365 aa  84.7  2e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  28.97 
 
 
362 aa  84  3e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  27.37 
 
 
373 aa  79.3  1e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  27.37 
 
 
373 aa  79  1e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  27.37 
 
 
373 aa  79.3  1e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  27.37 
 
 
373 aa  78.2  2e-13  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  27.37 
 
 
373 aa  78.2  2e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  27.37 
 
 
373 aa  78.2  2e-13  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  27.37 
 
 
373 aa  78.2  2e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  28.53 
 
 
357 aa  77  4e-13  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  26.84 
 
 
369 aa  77.4  4e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  26.92 
 
 
373 aa  75.9  9e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  30.34 
 
 
337 aa  75.9  9e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.01 
 
 
373 aa  75.5  1e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  29.01 
 
 
373 aa  75.5  1e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  28.73 
 
 
383 aa  75.1  1e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  27.88 
 
 
376 aa  75.5  1e-12  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.65 
 
 
373 aa  74.3  3e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  22.96 
 
 
393 aa  73.9  4e-12  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.55 
 
 
439 aa  73.9  4e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3042  hypothetical protein  30.31 
 
 
431 aa  72  1e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  25.61 
 
 
314 aa  72  1e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  35.96 
 
 
439 aa  71.2  3e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  25.42 
 
 
371 aa  70.9  3e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  40.69 
 
 
367 aa  70.5  4e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  40.69 
 
 
367 aa  70.5  4e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  40.69 
 
 
367 aa  70.5  4e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  40.69 
 
 
345 aa  70.5  5e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  40.69 
 
 
367 aa  70.1  5e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  40.69 
 
 
367 aa  70.1  5e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  40.69 
 
 
371 aa  70.1  5e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.21 
 
 
373 aa  70.1  6e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  25.21 
 
 
373 aa  68.9  1e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  25.21 
 
 
373 aa  68.9  1e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  28.33 
 
 
372 aa  67.8  3e-10  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.7 
 
 
369 aa  67  4e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  30.65 
 
 
397 aa  66.2  8e-10  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  30.65 
 
 
397 aa  66.2  8e-10  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  41.79 
 
 
359 aa  65.5  1e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  40.3 
 
 
359 aa  63.9  4e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1761  hypothetical protein  24.09 
 
 
312 aa  63.9  4e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  40.3 
 
 
359 aa  63.9  4e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  40.3 
 
 
359 aa  63.9  4e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2019  ImpA-related N-terminal family protein  24.09 
 
 
312 aa  63.9  4e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  40.3 
 
 
359 aa  63.9  4e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  40.3 
 
 
359 aa  63.9  4e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1045  hypothetical protein  24.09 
 
 
312 aa  63.9  4e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855246  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0750  hypothetical protein  24.09 
 
 
312 aa  63.9  4e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  40.3 
 
 
359 aa  63.9  4e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  23.78 
 
 
312 aa  60.1  5e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  23.84 
 
 
364 aa  60.1  6e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2073  hypothetical protein  23.78 
 
 
300 aa  59.7  7e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0699  ImpA-related N-terminal family protein  23.78 
 
 
312 aa  59.7  8e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  40.32 
 
 
357 aa  59.3  1e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3437  ImpA domain-containing protein  33.87 
 
 
337 aa  58.5  1e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00156719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3566  ImpA domain-containing protein  33.87 
 
 
328 aa  58.9  1e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0764  ImpA domain-containing protein  33.87 
 
 
337 aa  58.9  1e-07  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00810517  normal  0.0303687 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  38.71 
 
 
357 aa  57.8  3e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  38.61 
 
 
790 aa  57.4  4e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  38.61 
 
 
789 aa  55.8  1e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  23.26 
 
 
365 aa  55.5  1e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  27.51 
 
 
363 aa  54.7  3e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  22.71 
 
 
361 aa  53.9  4e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  22.47 
 
 
361 aa  52.8  9e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2370  ImpA domain-containing protein  22.15 
 
 
368 aa  50.8  3e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>