35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00980 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00980  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278124  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  89.94 
 
 
508 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2320  FHA domain-containing protein  64.19 
 
 
480 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00351705  hitchhiker  0.00389608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  33.61 
 
 
398 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  34.55 
 
 
463 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000012  uncharacterized protein ImpI/VasC  43.12 
 
 
397 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5422  FHA domain protein  35.04 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5581  FHA domain-containing protein  34.26 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.756831  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  38.68 
 
 
541 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2377  FHA domain-containing protein  36.79 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3483  hypothetical protein  36.89 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.181491  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  34.55 
 
 
453 aa  72.8  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  35.92 
 
 
409 aa  72.4  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3607  hypothetical protein  34.29 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42950  hypothetical protein  34.29 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.171842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2335  FHA domain-containing protein  36.46 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  37.74 
 
 
433 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2449  FHA domain-containing protein  40 
 
 
411 aa  67  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.01697  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6044  forkhead-type phosphopeptide-binding protein  37.5 
 
 
419 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05854  hypothetical protein  33.73 
 
 
504 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  37.66 
 
 
554 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000432  uncharacterized protein ImpI/VasC  34.18 
 
 
497 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00253  FHA domain protein  33.04 
 
 
470 aa  56.2  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1117  putative type VI secretion protein VasC  33.75 
 
 
453 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  34.94 
 
 
1281 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  40.74 
 
 
245 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0159  FHA domain containing protein  38.82 
 
 
172 aa  49.7  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  28.16 
 
 
398 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2456  FHA domain containing protein  36.84 
 
 
604 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.204622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3386  FHA domain-containing protein  36.96 
 
 
230 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0029589  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  30.3 
 
 
174 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.1 
 
 
903 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.29 
 
 
899 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0208  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
645 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0026  FHA domain-containing protein  42.42 
 
 
280 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>