113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00960 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  100 
 
 
154 aa  311  2e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  96.75 
 
 
154 aa  305  2e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  53.25 
 
 
155 aa  154  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  45.45 
 
 
171 aa  120  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  44.72 
 
 
167 aa  115  2e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  49.18 
 
 
168 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  44.63 
 
 
167 aa  113  9e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  39.1 
 
 
163 aa  112  2e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  39.1 
 
 
163 aa  112  2e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  43.44 
 
 
163 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  43.44 
 
 
163 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  38.22 
 
 
172 aa  108  2e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  43.09 
 
 
197 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.78046e-06 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  41.54 
 
 
170 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  42.75 
 
 
166 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  37.12 
 
 
168 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  32.37 
 
 
162 aa  97.8  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  35.38 
 
 
179 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  38.41 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  33.85 
 
 
180 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  35.61 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  35.61 
 
 
168 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  34.13 
 
 
210 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  30.41 
 
 
156 aa  94.4  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  36.23 
 
 
163 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  36.23 
 
 
166 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  34.13 
 
 
180 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  37.5 
 
 
160 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  42.11 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  41.67 
 
 
199 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  32.82 
 
 
180 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  38.52 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  38.52 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  38.52 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  38.52 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  36 
 
 
156 aa  87  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  31.01 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  32.69 
 
 
166 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  34.81 
 
 
172 aa  82.4  2e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  34.81 
 
 
172 aa  82.4  2e-15  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  33.61 
 
 
192 aa  82.4  2e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  34.81 
 
 
172 aa  82.4  2e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  34.88 
 
 
191 aa  82.4  2e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  34.81 
 
 
172 aa  82.4  2e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  34.81 
 
 
172 aa  82.4  2e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  33.09 
 
 
156 aa  82.8  2e-15  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  34.07 
 
 
179 aa  82.4  2e-15  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05853  hypothetical protein  33.86 
 
 
149 aa  80.5  9e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  37.27 
 
 
172 aa  79  2e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  30.07 
 
 
158 aa  79.3  2e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  33.33 
 
 
176 aa  79  2e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  38.52 
 
 
167 aa  78.2  3e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  38.52 
 
 
167 aa  78.2  3e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  38.52 
 
 
167 aa  78.2  3e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  31.78 
 
 
171 aa  77.4  7e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  32.74 
 
 
186 aa  76.3  1e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  32.74 
 
 
179 aa  75.9  2e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  32.74 
 
 
179 aa  75.9  2e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  34.55 
 
 
190 aa  73.2  1e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  28.79 
 
 
163 aa  72.8  2e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  33.33 
 
 
154 aa  72  3e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  28.12 
 
 
176 aa  69.7  1e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  33.33 
 
 
210 aa  68.2  4e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  4.03231e-07  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  30.23 
 
 
178 aa  67.8  6e-11  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  32.69 
 
 
174 aa  65.9  2e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  30.21 
 
 
164 aa  65.5  2e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2467  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  33.33 
 
 
164 aa  64.7  4e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  30.77 
 
 
173 aa  64.3  6e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  28.86 
 
 
154 aa  62.8  2e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58047e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  32.39 
 
 
157 aa  60.8  7e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  32.28 
 
 
193 aa  60.5  9e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  29.77 
 
 
292 aa  60.1  1e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  29.01 
 
 
200 aa  59.7  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  29.01 
 
 
204 aa  59.7  2e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  29.01 
 
 
204 aa  59.7  2e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  28.99 
 
 
202 aa  58.9  2e-08  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1105  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  28.86 
 
 
177 aa  57  9e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  26.83 
 
 
177 aa  56.6  1e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1224  type VI secretion lipoprotein family protein  28.86 
 
 
177 aa  55.5  3e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.804985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4079  hypothetical protein  29.07 
 
 
265 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185425  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0392  putative lipoprotein  29.7 
 
 
181 aa  53.1  1e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0319  putative lipoprotein  29.7 
 
 
181 aa  53.1  1e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  32.69 
 
 
207 aa  52.8  2e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  30.39 
 
 
181 aa  52  3e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2121  hypothetical protein  30.23 
 
 
265 aa  51.6  4e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0240  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  29.2 
 
 
174 aa  51.2  5e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0232  type VI secretion lipoprotein  29.2 
 
 
174 aa  50.8  7e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2618  hypothetical protein  30.23 
 
 
265 aa  50.4  8e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890059  normal  0.147502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  30.84 
 
 
240 aa  49.7  2e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3230  hypothetical protein  27.91 
 
 
265 aa  48.9  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2932  hypothetical protein  29.81 
 
 
203 aa  49.3  2e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.147593  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  30.84 
 
 
240 aa  49.7  2e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0465  hypothetical protein  30.39 
 
 
203 aa  48.9  3e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.144688  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2641  hypothetical protein  30.39 
 
 
203 aa  48.9  3e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212724  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  28.26 
 
 
189 aa  48.9  3e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0443  hypothetical protein  30.39 
 
 
203 aa  48.9  3e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  0.490833 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0400  hypothetical protein  30.1 
 
 
202 aa  48.5  3e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000206514  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0379  hypothetical protein  30.39 
 
 
202 aa  48.5  4e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0510591  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3557  hypothetical protein  30.39 
 
 
203 aa  48.5  4e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0566246  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  28.97 
 
 
240 aa  47.8  5e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>