42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00900 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  97.79 
 
 
226 aa  439  1e-122  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  61.61 
 
 
229 aa  254  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  2.05776e-05 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  35.53 
 
 
258 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  47.45 
 
 
478 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  37.84 
 
 
231 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34924e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  30.04 
 
 
243 aa  114  2e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  35.46 
 
 
483 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  27.65 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  32.09 
 
 
176 aa  95.5  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  31.96 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  48.08 
 
 
208 aa  88.6  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  35.09 
 
 
222 aa  80.9  1e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  44.57 
 
 
212 aa  78.2  9e-14  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  32.86 
 
 
241 aa  77.4  2e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  29.66 
 
 
240 aa  74.3  1e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  30.5 
 
 
235 aa  74.3  1e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  30.94 
 
 
232 aa  74.3  2e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  43.18 
 
 
237 aa  73.2  3e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  39.08 
 
 
234 aa  73.6  3e-12  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  32.09 
 
 
231 aa  70.1  2e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  34.81 
 
 
288 aa  69.7  3e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  33.82 
 
 
179 aa  68.9  6e-11  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  33.82 
 
 
174 aa  68.9  6e-11  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  34.07 
 
 
301 aa  68.6  9e-11  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  34.07 
 
 
301 aa  68.6  9e-11  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  33.33 
 
 
328 aa  67  2e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  67.4  2e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2454  hypothetical protein  37.86 
 
 
171 aa  67  2e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.29717  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  66.6  3e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2351  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  30.74 
 
 
233 aa  62.8  4e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976848 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3488  hypothetical protein  37.06 
 
 
163 aa  58.5  8e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0408329  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3132  hypothetical protein  37.06 
 
 
163 aa  58.5  9e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0956079  normal  0.131919 
 
 
-
 
NC_003296  RS01946  hypothetical protein  34.41 
 
 
328 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0051  hypothetical protein  28.71 
 
 
329 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3633  hypothetical protein  28.71 
 
 
329 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3150  hypothetical protein  28.71 
 
 
329 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3626  hypothetical protein  28.71 
 
 
329 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3651  hypothetical protein  28.71 
 
 
329 aa  42.4  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.729769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1716  hypothetical protein  28.71 
 
 
329 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.680589  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4922  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  28.71 
 
 
330 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179428  normal  0.0474232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2955  hypothetical protein  29.35 
 
 
329 aa  42  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>