More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00860 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00860  putative ATP-binding component of ABC transporter  100 
 
 
239 aa  460  1e-128  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000878092  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0144  ABC transporter ATP-binding protein  98.33 
 
 
239 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2312  ABC transporter related  64.71 
 
 
234 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  hitchhiker  4.68431e-05 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1669  ABC transporter related  51.26 
 
 
251 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52030  ATP binding component of ABC transporter  52.48 
 
 
238 aa  172  3e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1841  ABC transporter, ATP-binding protein  53.55 
 
 
238 aa  164  1e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.551478  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1317  ABC transporter related  44.59 
 
 
270 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2628  ABC transporter  47.8 
 
 
230 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166504  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2875  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 
230 aa  145  8e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0026509  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3220  ABC transporter related  50.5 
 
 
213 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3150  ABC transporter component  44 
 
 
240 aa  141  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4235  ABC transporter related  43.63 
 
 
228 aa  141  1e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0466  ABC transporter related protein  42.59 
 
 
222 aa  140  2e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  42.18 
 
 
223 aa  140  2e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.15 
 
 
238 aa  139  4e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  41.71 
 
 
223 aa  139  4e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  41.71 
 
 
223 aa  139  5e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
236 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  39.52 
 
 
256 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0901  ABC transporter related  42.99 
 
 
241 aa  134  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.69974  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.99 
 
 
227 aa  134  1e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  48.35 
 
 
215 aa  134  1e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  39.2 
 
 
256 aa  134  2e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  44.67 
 
 
225 aa  133  2e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  42.99 
 
 
230 aa  133  2e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  40.32 
 
 
235 aa  133  2e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  42.11 
 
 
214 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 
256 aa  132  4e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4367e-07 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  39.2 
 
 
256 aa  132  4e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  39.2 
 
 
256 aa  132  4e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.01 
 
 
648 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  38.19 
 
 
256 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  38.69 
 
 
256 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  38.69 
 
 
256 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  9.38072e-07 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  42.86 
 
 
228 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  38.69 
 
 
256 aa  132  7e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  41.62 
 
 
256 aa  131  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  2.06589e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  41.01 
 
 
647 aa  131  1e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  38.19 
 
 
256 aa  130  1e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 
223 aa  131  1e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  40.28 
 
 
236 aa  130  1e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
225 aa  131  1e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  39.81 
 
 
236 aa  130  1e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
648 aa  130  1e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  40.28 
 
 
236 aa  130  1e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.09 
 
 
648 aa  130  2e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 
238 aa  130  2e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.09 
 
 
648 aa  130  2e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  37.69 
 
 
256 aa  130  2e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  39.81 
 
 
236 aa  130  2e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  47.09 
 
 
227 aa  130  2e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  1.41091e-13 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.09 
 
 
648 aa  130  2e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  40.09 
 
 
648 aa  130  2e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  41.85 
 
 
229 aa  130  2e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.09 
 
 
648 aa  130  2e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  2.97537e-08  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 
250 aa  130  2e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.186741 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  40.09 
 
 
648 aa  130  2e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.09 
 
 
648 aa  130  2e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  39.17 
 
 
668 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  36.91 
 
 
240 aa  129  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  37.07 
 
 
227 aa  129  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  47.09 
 
 
228 aa  129  4e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  3.70874e-05 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  35.89 
 
 
250 aa  129  4e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  47.09 
 
 
228 aa  129  5e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  1.97884e-05 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  36.97 
 
 
225 aa  129  5e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  36.97 
 
 
225 aa  129  5e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1913  peptide ABC transporter ATPase  41.33 
 
 
259 aa  129  5e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.334881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  43.43 
 
 
228 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  47.34 
 
 
227 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  37.09 
 
 
244 aa  128  7e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  33.64 
 
 
224 aa  128  7e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  38.87 
 
 
644 aa  128  7e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 
220 aa  128  7e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  43.66 
 
 
228 aa  128  8e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  48.4 
 
 
227 aa  128  9e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.07 
 
 
678 aa  128  1e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.05037e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  38.07 
 
 
678 aa  128  1e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2420  ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 
255 aa  127  1e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.658909  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  38.07 
 
 
678 aa  128  1e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.85404e-05  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2162  ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 
255 aa  127  1e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.754182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2146  ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 
255 aa  127  2e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.278232  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  34.27 
 
 
225 aa  127  2e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  42.19 
 
 
234 aa  127  2e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  34.56 
 
 
237 aa  127  2e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  38.79 
 
 
232 aa  126  2e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2972  ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 
255 aa  127  2e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.344281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2355  ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 
255 aa  127  2e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  36.02 
 
 
266 aa  127  2e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  41.75 
 
 
219 aa  127  2e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2490  ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 
270 aa  127  2e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.755313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2310  ABC transporter related  35.55 
 
 
253 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2196  ABC transporter related  35.55 
 
 
258 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111069  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  38.76 
 
 
222 aa  126  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2406  ABC transporter, ATP-binding protein  35.07 
 
 
255 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  43.68 
 
 
217 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  38.32 
 
 
228 aa  125  4e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  38.79 
 
 
239 aa  125  4e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 
233 aa  126  4e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  45.36 
 
 
225 aa  126  4e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1360  ABC transporter related  35.32 
 
 
225 aa  125  4e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0276671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>