20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00730 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00730  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  289  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0061  putative lipoprotein  97.93 
 
 
145 aa  247  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0150  lipoprotein, putative  48.48 
 
 
144 aa  124  4e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0042  putative lipoprotein  48.87 
 
 
162 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0106  hypothetical protein  49.6 
 
 
137 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0106  lipoprotein  49.6 
 
 
137 aa  117  5e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.39404e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0091  putative lipoprotein  48.8 
 
 
137 aa  117  8e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0109  lipoprotein  48.8 
 
 
137 aa  116  8e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.655067  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0095  putative lipoprotein  51.26 
 
 
139 aa  110  7e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4454  hypothetical protein  44.72 
 
 
139 aa  102  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01170  hypothetical protein  45.9 
 
 
138 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2584  lipoprotein  45.86 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.968594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0110  lipoprotein  33.06 
 
 
137 aa  78.2  3e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604629  normal  0.0221205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0094  putative lipoprotein  37.3 
 
 
140 aa  76.6  1e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0107  lipoprotein  33.58 
 
 
137 aa  75.5  2e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.52453e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0107  hypothetical protein  37.5 
 
 
137 aa  75.5  2e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0092  putative lipoprotein  36.61 
 
 
137 aa  74.7  4e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01160  hypothetical protein  36.75 
 
 
139 aa  69.3  1e-11  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00740  putative lipoprotein  34.19 
 
 
138 aa  68.2  3e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0062  putative lipoprotein  34.19 
 
 
138 aa  67.8  4e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>