21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00650 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  287  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  96.43 
 
 
142 aa  275  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 
178 aa  94.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  34.91 
 
 
143 aa  79  2e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  3.44419e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  36.79 
 
 
144 aa  76.3  1e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  29.91 
 
 
141 aa  71.2  5e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  32.5 
 
 
166 aa  69.7  1e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.93 
 
 
193 aa  65.9  2e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.19 
 
 
150 aa  63.9  8e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  29.41 
 
 
139 aa  62.8  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.17 
 
 
142 aa  61.2  4e-09  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 
137 aa  60.5  7e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  1.67326e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  32.08 
 
 
135 aa  56.2  2e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  54.7  4e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 
152 aa  49.3  2e-05  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  31.33 
 
 
143 aa  48.5  3e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  31.33 
 
 
143 aa  48.5  3e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.42 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  31.34 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  28.1 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>