26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00620 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0052  hypothetical protein  91.86 
 
 
553 aa  1018  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00620  hypothetical protein  100 
 
 
553 aa  1118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.486509  normal  0.628936 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2869  hypothetical protein  42.42 
 
 
537 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2117  secreted protein  30.8 
 
 
415 aa  161  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.512527  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2682  hypothetical protein  37.41 
 
 
453 aa  154  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4467  secreted protein  36.59 
 
 
423 aa  119  1e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.207667  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0578  hypothetical protein  28.92 
 
 
385 aa  117  4e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.056117  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0546  hypothetical protein  27.94 
 
 
394 aa  115  1e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0603  hypothetical protein  27.78 
 
 
386 aa  115  2e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0835  hypothetical protein  28.02 
 
 
385 aa  115  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4131  hypothetical protein  26.71 
 
 
388 aa  115  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0130576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1934  hypothetical protein  31.05 
 
 
364 aa  114  4e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3523  hypothetical protein  28.47 
 
 
384 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0015438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3969  hypothetical protein  27.4 
 
 
390 aa  110  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3441  hypothetical protein  26.35 
 
 
385 aa  110  8e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00415893  normal  0.25947 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0844  hypothetical protein  28.22 
 
 
389 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.969791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3329  hypothetical protein  26.25 
 
 
385 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0837  hypothetical protein  28.22 
 
 
389 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.240462  hitchhiker  4.96305e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0812  hypothetical protein  28.22 
 
 
389 aa  108  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000162038  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0693  hypothetical protein  26.01 
 
 
385 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  2.26756e-05  normal  0.897132 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3158  hypothetical protein  27.25 
 
 
384 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0013201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3221  hypothetical protein  33.79 
 
 
386 aa  103  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0332861  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2971  hypothetical protein  31.6 
 
 
399 aa  94  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0733  hypothetical protein  26.75 
 
 
391 aa  94  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6996  hypothetical protein  37.65 
 
 
500 aa  81.3  4e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17670  hypothetical protein  43.7 
 
 
279 aa  79  2e-13  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.276623  normal  0.654681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>