42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00590 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00590  putative lipoprotein  100 
 
 
169 aa  337  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.592522  normal  0.156495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  97.04 
 
 
221 aa  312  2e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  69.77 
 
 
223 aa  241  4e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  73.37 
 
 
220 aa  236  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  62.72 
 
 
225 aa  224  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  62.72 
 
 
218 aa  221  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  62.72 
 
 
218 aa  221  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  62.72 
 
 
218 aa  221  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  67.06 
 
 
219 aa  219  1e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  60.95 
 
 
219 aa  218  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  60.95 
 
 
219 aa  216  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  65.87 
 
 
221 aa  214  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  62.13 
 
 
219 aa  213  1e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  61.76 
 
 
224 aa  211  4e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  61.63 
 
 
224 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  61.63 
 
 
224 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  61.63 
 
 
228 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  61.63 
 
 
224 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  61.63 
 
 
228 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  60.59 
 
 
224 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  60.59 
 
 
224 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  61.63 
 
 
224 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  61.63 
 
 
224 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  60.59 
 
 
224 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  61.54 
 
 
219 aa  201  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  59.3 
 
 
224 aa  199  1e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  56.21 
 
 
221 aa  197  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  56.44 
 
 
224 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  59.01 
 
 
220 aa  184  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  55.83 
 
 
224 aa  183  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  55.88 
 
 
219 aa  177  6e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  45.73 
 
 
225 aa  135  3e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0882  glycosyltransferase  49.11 
 
 
223 aa  127  8e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1495  lipoprotein  40.94 
 
 
224 aa  116  2e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.196072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0394  putative lipoprotein  36.2 
 
 
231 aa  97.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0423  protein of unknown function DUF799  34.97 
 
 
224 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0422  protein of unknown function DUF799  34.97 
 
 
224 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4118  hypothetical protein  27.95 
 
 
230 aa  73.6  1e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1766  hypothetical protein  29.38 
 
 
202 aa  68.2  5e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12485  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05523  hypothetical protein  31.13 
 
 
214 aa  68.2  5e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3789  hypothetical protein  29.84 
 
 
245 aa  65.1  4e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00728655  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4671  hypothetical protein  26.71 
 
 
211 aa  64.3  7e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195271  normal  0.101554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>