More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00440 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
268 aa  539  1e-152  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  93.66 
 
 
268 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  83.96 
 
 
269 aa  451  1e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  81.72 
 
 
270 aa  445  1e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  80.6 
 
 
269 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  76.87 
 
 
269 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  76.12 
 
 
269 aa  415  1e-115  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.24366e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  75.75 
 
 
269 aa  414  1e-115  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  74.63 
 
 
270 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  75 
 
 
269 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  74.63 
 
 
269 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  61.03 
 
 
279 aa  343  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  61.03 
 
 
278 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  58.97 
 
 
277 aa  328  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  60.29 
 
 
278 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  59.04 
 
 
278 aa  324  8e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  58.82 
 
 
278 aa  324  9e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  59.93 
 
 
278 aa  323  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  60.66 
 
 
278 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  59.56 
 
 
279 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  62.13 
 
 
281 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  6.73783e-07 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  58.43 
 
 
263 aa  322  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  59.19 
 
 
279 aa  320  2e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  58.82 
 
 
279 aa  318  8e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  56.09 
 
 
279 aa  318  8e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  61.66 
 
 
263 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  57.72 
 
 
278 aa  315  4e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  55.15 
 
 
281 aa  315  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  58.4 
 
 
267 aa  313  2e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  57.41 
 
 
278 aa  311  6e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  55.81 
 
 
272 aa  311  6e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  56.25 
 
 
279 aa  311  7e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  56.46 
 
 
280 aa  310  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  54.41 
 
 
279 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  57.2 
 
 
277 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  56.3 
 
 
280 aa  308  4e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  58.3 
 
 
279 aa  309  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  54.04 
 
 
279 aa  308  6e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  57.71 
 
 
263 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  57.71 
 
 
263 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  57.2 
 
 
275 aa  299  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1402  tryptophan synthase subunit alpha  60.15 
 
 
282 aa  294  8e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.362344 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  54.28 
 
 
265 aa  284  9e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  55.3 
 
 
271 aa  280  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  57.44 
 
 
271 aa  263  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  53.36 
 
 
266 aa  261  8e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4977  tryptophan synthase subunit alpha  56.55 
 
 
275 aa  258  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  54.21 
 
 
274 aa  255  6e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  55.1 
 
 
276 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  49.81 
 
 
267 aa  249  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1063  tryptophan synthase subunit alpha  52.45 
 
 
264 aa  245  5e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50074  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  49.62 
 
 
267 aa  245  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  47.18 
 
 
268 aa  244  1e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  48.69 
 
 
266 aa  244  1e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  49.25 
 
 
268 aa  242  4e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  48.86 
 
 
267 aa  242  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  46.04 
 
 
271 aa  239  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  48.5 
 
 
272 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  48.5 
 
 
272 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  53.16 
 
 
267 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  46.79 
 
 
271 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0090  tryptophan synthase, alpha chain  54.43 
 
 
265 aa  235  6e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  46.18 
 
 
273 aa  234  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  45.39 
 
 
269 aa  234  1e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  47.37 
 
 
264 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  46.33 
 
 
272 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  46.97 
 
 
273 aa  229  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  47.64 
 
 
270 aa  229  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  41.22 
 
 
262 aa  229  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  44.03 
 
 
268 aa  228  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  44.62 
 
 
265 aa  228  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  49.62 
 
 
277 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  47.45 
 
 
274 aa  227  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  44.62 
 
 
265 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  48.52 
 
 
271 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  46.09 
 
 
270 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  46.4 
 
 
270 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  46.91 
 
 
265 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  44.92 
 
 
272 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  45.53 
 
 
265 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  42.59 
 
 
275 aa  222  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  8.97023e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  46.67 
 
 
271 aa  222  5e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  47.31 
 
 
271 aa  222  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  47.68 
 
 
271 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  50 
 
 
269 aa  221  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  45.45 
 
 
265 aa  221  1e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  44.3 
 
 
272 aa  221  1e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.94001e-09  hitchhiker  2.8477e-09 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  45.02 
 
 
264 aa  220  1e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  45.14 
 
 
265 aa  220  2e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  45.02 
 
 
269 aa  220  2e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  44.98 
 
 
285 aa  220  2e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  45.45 
 
 
268 aa  220  2e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  45.45 
 
 
268 aa  220  2e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  45.02 
 
 
269 aa  220  2e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  43.07 
 
 
272 aa  220  2e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1158  tryptophan synthase, alpha subunit  46.5 
 
 
276 aa  220  2e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.814053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  43.56 
 
 
265 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  47.46 
 
 
272 aa  219  4e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  42.7 
 
 
272 aa  218  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  46.22 
 
 
271 aa  218  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>