More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00380 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  79.24 
 
 
505 aa  832    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  76.31 
 
 
501 aa  811    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  75.3 
 
 
501 aa  806    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  77.11 
 
 
510 aa  816    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  79.44 
 
 
505 aa  836    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  79.84 
 
 
505 aa  835    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  100 
 
 
503 aa  1034    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  95.83 
 
 
503 aa  998    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  79.24 
 
 
505 aa  831    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  80.92 
 
 
502 aa  840    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  60.79 
 
 
517 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  60.79 
 
 
522 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  60.4 
 
 
517 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  60.79 
 
 
522 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  60.79 
 
 
522 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  60.79 
 
 
522 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  60.79 
 
 
522 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  60 
 
 
516 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  59.45 
 
 
513 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  60.59 
 
 
517 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  59.61 
 
 
516 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  60 
 
 
516 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  60 
 
 
516 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  58.51 
 
 
515 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  57.31 
 
 
518 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  67.38 
 
 
594 aa  599  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  58.46 
 
 
511 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  57.87 
 
 
512 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  59.21 
 
 
511 aa  594  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  59.45 
 
 
511 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  53.85 
 
 
509 aa  526  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  50.7 
 
 
504 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  50.3 
 
 
502 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  47.81 
 
 
502 aa  461  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  47.51 
 
 
502 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  48.02 
 
 
501 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  48.91 
 
 
501 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  47.82 
 
 
501 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  46.52 
 
 
504 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  47.48 
 
 
496 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  47.6 
 
 
498 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  45.87 
 
 
512 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  47.38 
 
 
503 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  45.56 
 
 
520 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  34.44 
 
 
489 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  31 
 
 
482 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  34.24 
 
 
535 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  30 
 
 
474 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  30.94 
 
 
572 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  30.33 
 
 
586 aa  171  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  30.41 
 
 
476 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  28.8 
 
 
526 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  30 
 
 
535 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  29.98 
 
 
496 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  28.46 
 
 
549 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  30.45 
 
 
487 aa  154  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  28.38 
 
 
499 aa  153  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  28.66 
 
 
511 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  29.01 
 
 
502 aa  147  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  28.6 
 
 
508 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  27.63 
 
 
537 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  29.08 
 
 
523 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  29.91 
 
 
494 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  24.73 
 
 
458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  28.54 
 
 
489 aa  140  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  29.14 
 
 
483 aa  139  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  26.39 
 
 
481 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  30.2 
 
 
480 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  28.92 
 
 
486 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  27.49 
 
 
523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  27.65 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  29.25 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  27.81 
 
 
489 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  27.8 
 
 
497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  27.57 
 
 
497 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  27.57 
 
 
497 aa  134  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  27.8 
 
 
497 aa  134  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  27.57 
 
 
497 aa  134  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  28.82 
 
 
497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  25.88 
 
 
514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  27.95 
 
 
526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  28.57 
 
 
565 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  27.57 
 
 
497 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  29.22 
 
 
536 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  28.25 
 
 
518 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  35.82 
 
 
554 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  27.29 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  27.18 
 
 
519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  26.03 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  26.22 
 
 
471 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  29.46 
 
 
466 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  26.6 
 
 
519 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  27.05 
 
 
485 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  28.31 
 
 
497 aa  126  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  29.19 
 
 
478 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29.27 
 
 
482 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  25.72 
 
 
501 aa  126  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  24.9 
 
 
480 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  29.87 
 
 
478 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  27.92 
 
 
459 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>