More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00250 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  100 
 
 
325 aa  660  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  93.23 
 
 
325 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  79.69 
 
 
325 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0059  alcohol dehydrogenase  80 
 
 
325 aa  520  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  78.46 
 
 
325 aa  515  1e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0023  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  76.62 
 
 
325 aa  517  1e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0173  quinone oxidoreductase  74.46 
 
 
325 aa  505  1e-142  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  72.31 
 
 
325 aa  491  1e-138  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.55478e-12 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  71.38 
 
 
325 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  71.38 
 
 
325 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  6.90857e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  72.31 
 
 
325 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  2.21127e-05 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  71.38 
 
 
325 aa  475  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3635  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  65.44 
 
 
328 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3497  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  64.22 
 
 
327 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0710  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  64.22 
 
 
331 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0742  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  63.61 
 
 
329 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3766  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  60.55 
 
 
327 aa  407  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.52302e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3856  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  60.55 
 
 
327 aa  407  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.323591  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4450  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  59.94 
 
 
329 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.553295 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4493  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  60.24 
 
 
327 aa  399  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966191  normal  0.0601641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4588  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  60.24 
 
 
327 aa  399  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4587  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  60.55 
 
 
327 aa  400  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4639  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  60.24 
 
 
327 aa  399  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0687735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4502  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  60.24 
 
 
327 aa  399  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0255  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  60.24 
 
 
327 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.263787  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5553  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  58.72 
 
 
327 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3977  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  58.72 
 
 
327 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03883  hypothetical protein  58.72 
 
 
327 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4603  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  58.72 
 
 
327 aa  391  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4291  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  58.72 
 
 
327 aa  391  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  60.49 
 
 
327 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4512  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  58.72 
 
 
327 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  57.85 
 
 
324 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03923  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  58.72 
 
 
327 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  58.41 
 
 
327 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4544  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  58.1 
 
 
327 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  57.85 
 
 
324 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.1 
 
 
326 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.98 
 
 
328 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  60.8 
 
 
324 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56 
 
 
327 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  57.36 
 
 
327 aa  368  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.79 
 
 
326 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.31 
 
 
323 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  55.38 
 
 
324 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 
324 aa  362  6e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  56.13 
 
 
328 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  55.38 
 
 
324 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.13 
 
 
328 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  58.46 
 
 
323 aa  359  3e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  57.06 
 
 
331 aa  356  3e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  55.42 
 
 
325 aa  355  4e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.31 
 
 
324 aa  355  4e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.08 
 
 
324 aa  355  6e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  56 
 
 
324 aa  355  8e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.46 
 
 
324 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  57.32 
 
 
326 aa  352  7e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56 
 
 
324 aa  350  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  55.08 
 
 
324 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.69 
 
 
331 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  55.69 
 
 
324 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  55.69 
 
 
324 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.08 
 
 
324 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  55.08 
 
 
324 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  55.08 
 
 
324 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  55.08 
 
 
324 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  55.08 
 
 
324 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  55.08 
 
 
324 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.21 
 
 
344 aa  349  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.73 
 
 
323 aa  349  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.42 
 
 
323 aa  348  8e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  55.08 
 
 
324 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  55.11 
 
 
323 aa  346  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  55.69 
 
 
331 aa  346  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.46 
 
 
324 aa  346  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  53.68 
 
 
330 aa  346  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  54.77 
 
 
324 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.77 
 
 
324 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  54.77 
 
 
324 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4628  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  54.46 
 
 
412 aa  341  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1596  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  53.99 
 
 
326 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  52.92 
 
 
325 aa  338  6e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  54.29 
 
 
325 aa  338  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.92 
 
 
323 aa  336  4e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.38359  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.23 
 
 
325 aa  335  4e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0756  putative quinone oxidoreductase  65.46 
 
 
257 aa  335  7e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.03949e-06  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  54.6 
 
 
326 aa  335  9e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2478  alcohol dehydrogenase  58.2 
 
 
325 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00177585  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  52.31 
 
 
324 aa  333  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2173  alcohol dehydrogenase  52.71 
 
 
330 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.133443 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  52 
 
 
325 aa  332  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7175  alcohol dehydrogenase  53.7 
 
 
327 aa  332  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.85 
 
 
323 aa  332  7e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5285  NADPH-dependent quinone oxidoreductase  52.31 
 
 
326 aa  329  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3028  alcohol dehydrogenase  53.23 
 
 
324 aa  329  5e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2009  alcohol dehydrogenase  54.46 
 
 
323 aa  329  5e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.792874  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.23 
 
 
326 aa  328  7e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.23 
 
 
326 aa  328  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.7 
 
 
322 aa  328  8e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  53.37 
 
 
326 aa  327  2e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>