109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_00210 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  100 
 
 
341 aa  688  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  97.95 
 
 
341 aa  648  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  78.26 
 
 
345 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  75.07 
 
 
341 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.9767e-06  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  73.02 
 
 
341 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  70.67 
 
 
341 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  72.43 
 
 
341 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  55.15 
 
 
338 aa  374  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  49.58 
 
 
352 aa  355  8e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  48.14 
 
 
338 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  45.38 
 
 
345 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  43.08 
 
 
383 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.32 
 
 
389 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  41.19 
 
 
345 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  41.19 
 
 
345 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  41.37 
 
 
341 aa  240  3e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  38.42 
 
 
350 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  41.53 
 
 
408 aa  232  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  36.19 
 
 
367 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  35.64 
 
 
365 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  36.47 
 
 
346 aa  229  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  39.71 
 
 
349 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  36.05 
 
 
403 aa  226  6e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 
374 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  36.23 
 
 
343 aa  221  1e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.54 
 
 
393 aa  219  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  37.94 
 
 
426 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  39.77 
 
 
394 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  35.33 
 
 
378 aa  217  3e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  38.15 
 
 
419 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  41.44 
 
 
405 aa  216  6e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  38.63 
 
 
401 aa  214  1e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  38.92 
 
 
417 aa  214  2e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  36.26 
 
 
369 aa  214  2e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  33.88 
 
 
374 aa  214  2e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.43599e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  33.61 
 
 
374 aa  214  3e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  37.74 
 
 
430 aa  213  5e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  35.08 
 
 
369 aa  213  5e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  33.7 
 
 
376 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35775e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  33.79 
 
 
374 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  37.79 
 
 
387 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  33.7 
 
 
376 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  33.7 
 
 
376 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  33.7 
 
 
376 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  34.38 
 
 
377 aa  209  4e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  40.11 
 
 
409 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  34.3 
 
 
377 aa  209  7e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  35.16 
 
 
360 aa  208  8e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  33.7 
 
 
362 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  35.19 
 
 
368 aa  206  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  42.28 
 
 
388 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  36.42 
 
 
349 aa  199  4e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  36.42 
 
 
349 aa  199  4e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  37.04 
 
 
420 aa  197  2e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  40 
 
 
390 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  38.74 
 
 
364 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  38.74 
 
 
395 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  39.88 
 
 
358 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  34.64 
 
 
366 aa  186  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  31.69 
 
 
361 aa  185  1e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  32.05 
 
 
377 aa  176  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  32.94 
 
 
391 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  31.89 
 
 
353 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  29.94 
 
 
364 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  32.3 
 
 
384 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  29.51 
 
 
364 aa  152  6e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  31.52 
 
 
384 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  29.53 
 
 
367 aa  145  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  34.92 
 
 
329 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  30.57 
 
 
333 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.22112e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  28.81 
 
 
435 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  30.51 
 
 
359 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  30.61 
 
 
440 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  30.61 
 
 
440 aa  122  1e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  30.32 
 
 
440 aa  121  2e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  27.58 
 
 
331 aa  115  1e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  29.27 
 
 
338 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  28.03 
 
 
339 aa  110  4e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  27.78 
 
 
335 aa  106  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  26.99 
 
 
340 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.7016e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  26.61 
 
 
333 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.0411e-06  hitchhiker  3.23717e-12 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  29.97 
 
 
335 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  30.03 
 
 
394 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.01658e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  29.46 
 
 
429 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  39.39 
 
 
377 aa  48.5  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2244  hypothetical protein  46 
 
 
156 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  45.83 
 
 
185 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  36.99 
 
 
205 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  31.17 
 
 
166 aa  46.2  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
356 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  35.8 
 
 
203 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  32.18 
 
 
161 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  39.34 
 
 
161 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4170  peptidoglycan-binding LysM  35 
 
 
163 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.301843  normal  0.177746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  39.34 
 
 
161 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2281  LysM domain-containing protein  37.5 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0169093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0419  Curli production assembly/transport component CsgG  27.05 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0420  Curli production assembly/transport component CsgG  27.05 
 
 
321 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690548  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  42.31 
 
 
1051 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  36.36 
 
 
158 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>