More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_18931 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 
284 aa  587  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  82.75 
 
 
284 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  82.75 
 
 
284 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  81.34 
 
 
290 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  62.54 
 
 
284 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  62.54 
 
 
284 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  62.19 
 
 
284 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  63.44 
 
 
285 aa  357  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  59.36 
 
 
284 aa  342  4e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30021  formyltetrahydrofolate deformylase  58.99 
 
 
296 aa  333  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53116 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 
284 aa  320  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  53.71 
 
 
284 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  53.71 
 
 
284 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  53.36 
 
 
284 aa  316  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  53.17 
 
 
284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  54.04 
 
 
284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 
287 aa  285  5e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  49.09 
 
 
289 aa  279  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  48.21 
 
 
288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.15 
 
 
309 aa  268  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  47.5 
 
 
296 aa  265  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  45.23 
 
 
284 aa  261  6.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  45.74 
 
 
293 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  47.08 
 
 
300 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  46.91 
 
 
295 aa  255  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  47.45 
 
 
285 aa  255  7e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  47.27 
 
 
287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  47.08 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  49.45 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  46.35 
 
 
284 aa  252  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  43.26 
 
 
296 aa  249  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  45.26 
 
 
297 aa  248  5e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  45.99 
 
 
283 aa  246  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  46.55 
 
 
287 aa  245  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  46.72 
 
 
291 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  43.8 
 
 
300 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  42.81 
 
 
291 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  43.77 
 
 
285 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  42.2 
 
 
284 aa  236  3e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  45.32 
 
 
310 aa  236  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  45.71 
 
 
289 aa  236  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  42.71 
 
 
284 aa  236  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  43.64 
 
 
299 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  43.99 
 
 
286 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  43.99 
 
 
286 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  44.12 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  42.66 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  40.5 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  42.7 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  43.37 
 
 
288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  42.12 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  44.06 
 
 
284 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  41.24 
 
 
290 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  44.09 
 
 
288 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  39.64 
 
 
283 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  42.25 
 
 
288 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  43.75 
 
 
295 aa  229  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  41.07 
 
 
283 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  41.82 
 
 
292 aa  229  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  42.86 
 
 
287 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  43.27 
 
 
282 aa  229  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  41.7 
 
 
283 aa  228  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  41.61 
 
 
283 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  41.07 
 
 
283 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  41.61 
 
 
283 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  41.61 
 
 
283 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  45.26 
 
 
287 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  41.61 
 
 
283 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  41.44 
 
 
286 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  42.81 
 
 
285 aa  227  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  45.62 
 
 
285 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  44.53 
 
 
287 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  42.09 
 
 
284 aa  226  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  41.58 
 
 
299 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  42.55 
 
 
282 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2482  formyltetrahydrofolate deformylase  44.16 
 
 
292 aa  225  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4036  formyltetrahydrofolate deformylase  44.16 
 
 
292 aa  225  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  41.9 
 
 
288 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  42.55 
 
 
282 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  42.45 
 
 
283 aa  225  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2756  formyltetrahydrofolate deformylase  42.09 
 
 
288 aa  225  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  40.86 
 
 
282 aa  225  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  42.14 
 
 
282 aa  225  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  40.22 
 
 
316 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  40.98 
 
 
267 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  41.07 
 
 
283 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  42.7 
 
 
282 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  41.16 
 
 
295 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  41.58 
 
 
284 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  42.55 
 
 
282 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3620  formyltetrahydrofolate deformylase  43.84 
 
 
292 aa  222  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44906  formyltetrahydrofolate deformylase  42.7 
 
 
304 aa  222  7e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.104572  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  40.86 
 
 
283 aa  221  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  41.67 
 
 
289 aa  221  9e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  40.5 
 
 
283 aa  221  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  42.86 
 
 
284 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  42.65 
 
 
280 aa  221  9e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  41.81 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  39.58 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>