174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_18701 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_18891  ATP-dependent DNA ligase  78.88 
 
 
437 aa  693  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1772  ATP-dependent DNA ligase  79.37 
 
 
437 aa  696  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18701  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 
412 aa  857  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18701  ATP-dependent DNA ligase  78.88 
 
 
437 aa  689  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1534  DNA ligase, ATP-dependent  31.34 
 
 
432 aa  115  1e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  1.20841e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  30.82 
 
 
568 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0266  hypothetical protein  26.28 
 
 
455 aa  90.5  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186221 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  24.8 
 
 
567 aa  86.3  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.63 
 
 
552 aa  77.8  3e-13  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1780  ATP-dependent DNA ligase  24.92 
 
 
520 aa  74.7  2e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161511  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1799  ATP-dependent DNA ligase  24.92 
 
 
520 aa  74.7  2e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07397  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1846  ATP-dependent DNA ligase  24.92 
 
 
520 aa  74.7  2e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297739  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.51 
 
 
531 aa  74.7  3e-12  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0039  ATP-dependent DNA ligase  28.02 
 
 
583 aa  72.8  1e-11  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2781  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.29 
 
 
556 aa  71.2  3e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  28.81 
 
 
861 aa  69.7  9e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.06 
 
 
553 aa  69.7  1e-10  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.43 
 
 
588 aa  68.2  2e-10  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.12 
 
 
550 aa  68.9  2e-10  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  28.16 
 
 
584 aa  68.2  3e-10  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.54 
 
 
562 aa  68.2  3e-10  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  29.07 
 
 
584 aa  67.4  4e-10  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  27.41 
 
 
508 aa  66.6  7e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.11 
 
 
592 aa  66.6  8e-10  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2592  ATP-dependent DNA ligase  24.28 
 
 
507 aa  66.2  1e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84866e-07 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  27.85 
 
 
837 aa  65.9  1e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1225  DNA ligase  27.62 
 
 
302 aa  65.1  2e-09  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0877468  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1395  DNA ligase  28.26 
 
 
272 aa  65.1  2e-09  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.168291  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1436  DNA ligase  35 
 
 
298 aa  64.7  3e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  27.08 
 
 
584 aa  63.9  5e-09  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  24.62 
 
 
831 aa  63.5  6e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.01 
 
 
592 aa  63.2  8e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  25.3 
 
 
847 aa  63.2  9e-09  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  28.39 
 
 
866 aa  62.4  1e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1170  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.39 
 
 
601 aa  61.6  2e-08  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.51261  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2882  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  27.7 
 
 
547 aa  61.6  2e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.812327  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4321  ATP-dependent DNA ligase  26.1 
 
 
511 aa  61.6  3e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  28.02 
 
 
851 aa  60.8  4e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0750  ATP-dependent DNA ligase  26.33 
 
 
601 aa  60.5  5e-08  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  25.09 
 
 
871 aa  60.5  5e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2639  DNA ligase  24.64 
 
 
281 aa  60.5  6e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00943925  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2025  ATP-dependent DNA ligase  24.85 
 
 
534 aa  60.5  6e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189008  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.3 
 
 
590 aa  59.7  8e-08  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  25.53 
 
 
864 aa  59.7  9e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  27.05 
 
 
507 aa  59.3  1e-07  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0036  DNA ligase  29.19 
 
 
312 aa  59.3  1e-07  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  27.87 
 
 
853 aa  59.3  1e-07  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  26.07 
 
 
843 aa  58.2  2e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.43 
 
 
522 aa  58.5  2e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0782  DNA ligase  25.37 
 
 
275 aa  58.5  2e-07  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.200091  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.45 
 
 
509 aa  58.9  2e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  28.26 
 
 
513 aa  58.9  2e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1643  DNA ligase (ATP)  24.56 
 
 
549 aa  57.8  4e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  26.46 
 
 
513 aa  57.4  5e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0465  DNA ligase  25.42 
 
 
275 aa  57.4  5e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51001  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1157  DNA ligase  30.58 
 
 
279 aa  57  6e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148017  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1672  DNA ligase  26.1 
 
 
266 aa  57  7e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  23.99 
 
 
321 aa  56.6  7e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  26.86 
 
 
513 aa  56.6  8e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3695  DNA ligase  25.33 
 
 
295 aa  56.2  9e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2396  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  24.8 
 
 
349 aa  56.6  9e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2511  DNA ligase  30.95 
 
 
291 aa  56.2  9e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1235  DNA ligase  40.96 
 
 
279 aa  56.2  1e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1685  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.38 
 
 
573 aa  56.2  1e-06  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  28.86 
 
 
902 aa  55.8  1e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2739  DNA ligase  33.08 
 
 
283 aa  55.8  1e-06  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2019  DNA ligase  39.08 
 
 
295 aa  55.5  2e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  25.1 
 
 
778 aa  55.1  2e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2369  DNA ligase  25.77 
 
 
279 aa  55.5  2e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.815308  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0077  DNA ligase  31.97 
 
 
298 aa  54.7  3e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6876  ATP dependent DNA ligase  24.89 
 
 
343 aa  54.3  3e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  23.77 
 
 
576 aa  54.3  3e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0293  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  24.62 
 
 
573 aa  54.3  4e-06  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.33298  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0150  ATP-dependent DNA ligase  24.68 
 
 
598 aa  54.3  4e-06  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.132861  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  24.7 
 
 
939 aa  53.9  5e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3497  DNA ligase  38.37 
 
 
337 aa  53.9  5e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  27.9 
 
 
825 aa  53.9  5e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0128  DNA ligase D  23.55 
 
 
871 aa  53.5  6e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  26.84 
 
 
846 aa  53.5  7e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2416  DNA ligase  35.04 
 
 
306 aa  53.1  8e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04170  DNA ligase, putative  25 
 
 
803 aa  53.1  8e-06  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  26.14 
 
 
797 aa  52.8  1e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0272  ATP-dependent DNA ligase  26.75 
 
 
512 aa  52.8  1e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000560558  hitchhiker  0.000258657 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1990  DNA ligase  36.59 
 
 
288 aa  52.4  1e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542431 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2712  DNA ligase  31.15 
 
 
303 aa  52.4  1e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226859 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0812  DNA ligase  32.48 
 
 
306 aa  52.4  1e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.35337  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  26.07 
 
 
847 aa  52.8  1e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0793  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  23.96 
 
 
573 aa  53.1  1e-05  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  27.54 
 
 
519 aa  51.6  2e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2845  ATP-dependent DNA ligase  24.89 
 
 
509 aa  51.6  2e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  24.58 
 
 
503 aa  51.6  2e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1484  DNA ligase  28.18 
 
 
282 aa  52.4  2e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  24.62 
 
 
848 aa  51.2  3e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3852  ATP dependent DNA ligase  26.02 
 
 
315 aa  51.2  3e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  25.5 
 
 
865 aa  51.2  3e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003526  ATP-dependent DNA ligase  25.75 
 
 
281 aa  51.6  3e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  22.43 
 
 
651 aa  51.2  3e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  23.85 
 
 
818 aa  51.2  3e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.09107e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  25.32 
 
 
603 aa  51.2  4e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1324  DNA ligase  24.72 
 
 
269 aa  50.4  5e-05  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>