More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_18321 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 348 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  55.13 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  53.27 
 
 		 332 aa  364  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  52.98 
 
 		 333 aa  362  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  52.49 
 
 		 332 aa  359  4e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  52.08 
 
 		 329 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  50.75 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  50.74 
 
 		 332 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  50.75 
 
 		 337 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  51.19 
 
 		 332 aa  351  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  50.6 
 
 		 332 aa  348  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  51.33 
 
 		 325 aa  334  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  52.07 
 
 		 326 aa  333  2e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  49.26 
 
 		 333 aa  332  8e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  51.34 
 
 		 354 aa  326  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  48.36 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  48.25 
 
 		 324 aa  322  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  47.77 
 
 		 323 aa  318  7.999999999999999e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  48.96 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  49.25 
 
 		 324 aa  315  8e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  47.92 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  49.11 
 
 		 328 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  48.14 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  49.11 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  48.66 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  47.6 
 
 		 329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 328 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  48.37 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  47.48 
 
 		 337 aa  305  9.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  47.62 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  46.39 
 
 		 327 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  46.04 
 
 		 327 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  47.62 
 
 		 330 aa  302  7.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  46.43 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  47.02 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  47.02 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  47.46 
 
 		 332 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 330 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  45.97 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  49.4 
 
 		 329 aa  296  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  44.51 
 
 		 331 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  45.67 
 
 		 320 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  46.83 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  46.27 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  47.46 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  47.46 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  45.51 
 
 		 329 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  44.18 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  44.18 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  45.97 
 
 		 328 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  44.38 
 
 		 330 aa  289  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  45.13 
 
 		 324 aa  288  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  44.97 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  44.35 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  44.05 
 
 		 331 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  45.29 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  46.43 
 
 		 326 aa  280  4e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  44.12 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  42.86 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  44.94 
 
 		 331 aa  279  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  44.12 
 
 		 330 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 328 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  44.51 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  45.83 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  43.58 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  46.57 
 
 		 332 aa  276  5e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  44.35 
 
 		 334 aa  275  8e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  45.27 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  43.92 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  44.38 
 
 		 351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  43.92 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  43.92 
 
 		 349 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  43.01 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  43.75 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  44.67 
 
 		 328 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  40.83 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  43.66 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  42.56 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  46.87 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  42.48 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  44.18 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  44.08 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  43.53 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  45.67 
 
 		 321 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  42.77 
 
 		 322 aa  262  4.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  45.67 
 
 		 321 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  43.88 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  41.4 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>