More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_18261 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_18261  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 328 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.606891  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18471  putative transcriptional regulator  85.06 
 
 		 328 aa  584  1e-166  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18281  putative transcriptional regulator  84.45 
 
 		 328 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1730  GntR family transcriptional regulator  83.84 
 
 		 328 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.577287  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17651  putative transcriptional regulator  70.95 
 
 		 328 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0130  GntR family transcriptional regulator  69.33 
 
 		 333 aa  485  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.389862  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0083  GntR family transcriptional regulator  69.02 
 
 		 333 aa  485  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01531  putative transcriptional regulator  67.99 
 
 		 329 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1216  GntR family transcriptional regulator  67.78 
 
 		 329 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20911  putative transcriptional regulator  66.57 
 
 		 329 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.605524  normal  0.66693 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0090  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2504  GntR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2238  transcriptional regulator, GntR family  44.48 
 
 		 331 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.473072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3826  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 329 aa  295  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3775  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 329 aa  295  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1082  transcriptional regulator, GntR family  44.48 
 
 		 325 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.864397 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2929  GntR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 328 aa  285  5.999999999999999e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.665926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3734  GntR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00205415  normal  0.192396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 475 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6371  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 127 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2199  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.958543 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  36.84 
 
 		 156 aa  68.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  40.96 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2407  transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 		 159 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00608999  normal  0.35427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2376  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 131 aa  65.1  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.2044  normal  0.545557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03060  predicted transcriptional regulator  28.12 
 
 		 126 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0898  GntR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1871  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0144797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 501 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2227  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0653  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.90305  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8884  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.11 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.73 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15470  regulatory protein GntR HTH  24.62 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230103  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.3 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 502 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 502 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 502 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.87 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 502 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 502 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.91 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 564 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 561 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 564 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 564 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 564 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 562 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0050  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.898353  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0646  transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.82 
 
 		 495 aa  56.2  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.7 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 496 aa  56.2  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  53.06 
 
 		 509 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.51 
 
 		 503 aa  56.2  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.03 
 
 		 507 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  41.03 
 
 		 504 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 130 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  44.62 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  29.56 
 
 		 467 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 488 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3575  transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 		 130 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00235324  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.65 
 
 		 501 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 255 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  39.19 
 
 		 120 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 520 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4287  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 512 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00564262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 473 aa  53.9  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3130  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.467751  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 499 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.03 
 
 		 494 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 513 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 121 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1315  transcriptional regulator, GntR family  34.94 
 
 		 125 aa  53.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0274198  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0748  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.75 
 
 		 471 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 133 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 133 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1604  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.14 
 
 		 494 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2305  transcriptional regulator, GntR family  30.49 
 
 		 126 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000453949  hitchhiker  0.000942984 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 121 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  39.47 
 
 		 523 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 129 aa  52.8  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.9 
 
 		 485 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3319  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  52.17 
 
 		 470 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.823033  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0707  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3330  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 484 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1229  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  45.9 
 
 		 485 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 233 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 473 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 489 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  44.23 
 
 		 484 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>