More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_17381 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 100 aa  203  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  97 
 
 		 100 aa  199  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  96 
 
 		 100 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  96 
 
 		 100 aa  197  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  79 
 
 		 100 aa  169  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  77 
 
 		 100 aa  167  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  77 
 
 		 100 aa  166  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  77 
 
 		 103 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  81.44 
 
 		 97 aa  165  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  77 
 
 		 103 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  69.23 
 
 		 100 aa  137  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  64.84 
 
 		 105 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  56.57 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  57.61 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  57.61 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  55.34 
 
 		 104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  54 
 
 		 104 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  53.06 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  55.95 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  54.65 
 
 		 94 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  52.17 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 		 94 aa  93.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  52.87 
 
 		 96 aa  88.6  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  52.87 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  52.87 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  48.45 
 
 		 101 aa  88.6  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  52.33 
 
 		 94 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  49.45 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  49.43 
 
 		 98 aa  86.7  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  53.41 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  52.81 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  48.91 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  51.02 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 98 aa  84.3  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  45.98 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  49.43 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  45.98 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  51.72 
 
 		 95 aa  84.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 98 aa  83.6  9e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  45.98 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  49.46 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  46.59 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  44.68 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  44.09 
 
 		 97 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  48.31 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  44.44 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  48.28 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  49.44 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  44.32 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  46.88 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 113 aa  80.1  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  52.33 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  50.55 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  46.39 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  48.86 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  44.57 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  48.28 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  45.56 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0340  50S ribosomal protein L23  43 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586276  hitchhiker  0.000885961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  44.9 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  52.33 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0275  50S ribosomal protein L23  43.43 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0280  50S ribosomal protein L23  43.43 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00123621  hitchhiker  0.00000000748159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  44.83 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  43.3 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  43.18 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  44 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2905  Ribosomal protein L25/L23  44.71 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  47.13 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  43.3 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  48.84 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>