More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_16871 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_16871  30S ribosomal protein S10  100 
 
 
106 aa  213  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16981  30S ribosomal protein S10  97.17 
 
 
106 aa  209  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17101  30S ribosomal protein S10  97.17 
 
 
106 aa  209  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1073  30S ribosomal protein S10  96.23 
 
 
106 aa  208  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2023  30S ribosomal protein S10  96.23 
 
 
106 aa  208  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.532021  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19481  30S ribosomal protein S10  96.23 
 
 
106 aa  208  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1599  30S ribosomal protein S10  95.28 
 
 
106 aa  207  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16301  30S ribosomal protein S10  93.4 
 
 
106 aa  205  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0319  30S ribosomal protein S10  93.4 
 
 
106 aa  205  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717692  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23661  30S ribosomal protein S10  92.45 
 
 
106 aa  201  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.09836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1286  30S ribosomal protein S10  86.41 
 
 
105 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00174582  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0663  30S ribosomal protein S10  86.41 
 
 
105 aa  186  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0883  30S ribosomal protein S10  84.47 
 
 
105 aa  185  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0048  30S ribosomal protein S10  84.47 
 
 
105 aa  184  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0477  30S ribosomal protein S10  82.52 
 
 
105 aa  182  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0395283  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1535  30S ribosomal protein S10  86 
 
 
104 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1560  30S ribosomal protein S10  86 
 
 
104 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0613138  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  83.5 
 
 
105 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30445  Plastid ribosomal protein S10 small ribosomal subunit  65.31 
 
 
136 aa  148  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.499456  normal  0.195727 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  148  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 
102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  65.35 
 
 
103 aa  145  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  65.69 
 
 
102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  64.71 
 
 
102 aa  144  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 
102 aa  142  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
102 aa  141  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  141  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
102 aa  141  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  141  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5123  ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  140  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.971498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  140  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  61.76 
 
 
107 aa  140  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  63 
 
 
103 aa  140  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
102 aa  139  9e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  139  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0961  ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000260411  hitchhiker  0.000000000152054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1085  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  63 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0980  ribosomal protein S10  61.9 
 
 
106 aa  139  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.604539  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10030  SSU ribosomal protein S10P  60.78 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000017716  hitchhiker  0.00000000188362 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000428723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000209715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000227261  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  138  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0846  SSU ribosomal protein S10P  65.69 
 
 
103 aa  138  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264723  decreased coverage  0.00000947215 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5196  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  138  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000324324  unclonable  1.19812e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0105  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.602740000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000504345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0130  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000306915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  63 
 
 
103 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0057  30S ribosomal protein S10  57.84 
 
 
102 aa  137  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000459643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0110  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000437851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  137  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2715  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
102 aa  137  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000442606  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2400  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
102 aa  137  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 
102 aa  137  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0106  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  137  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1908  30S ribosomal protein S10  58.82 
 
 
102 aa  136  7.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000309802  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03970  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 
101 aa  136  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.914635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1039  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 
101 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1012  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 
101 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5050  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 
101 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.38543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1029  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 
101 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.632906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1304  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 
101 aa  136  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155802  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_002620  TC0720  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
105 aa  135  1e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0939005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  62 
 
 
103 aa  136  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0841  ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  135  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  60.58 
 
 
123 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0561  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
102 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0398  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
101 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1291  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  135  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123252  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1832  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
102 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000860395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2319  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
102 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000523033  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2278  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
102 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000204136  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10714  30S ribosomal protein S10  58.42 
 
 
101 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.193361 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1395  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  135  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00721101  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0594  SSU ribosomal protein S10P  60.78 
 
 
102 aa  135  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000677882  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
102 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2688  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.832571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 
102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1146  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00144145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4027  30S ribosomal protein S10  58.82 
 
 
102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000005274 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2402  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000476333  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2976  30S ribosomal protein S10  56.86 
 
 
102 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1345  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312234  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05710  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
101 aa  134  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.751469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0109  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 
102 aa  134  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000877818  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  58.82 
 
 
102 aa  134  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3329  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000189761 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0932  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 
102 aa  134  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0025936  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4316  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 
102 aa  134  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>