More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_16801 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_17031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  81.62 
 
 		 408 aa  707    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.118927  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16911  L,L-diaminopimelate aminotransferase  81.13 
 
 		 408 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16801  L,L-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 		 408 aa  847    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1592  L,L-diaminopimelate aminotransferase  82.11 
 
 		 408 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.518523  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23741  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.63 
 
 		 417 aa  614  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113284 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1066  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.61 
 
 		 408 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19411  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.61 
 
 		 408 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0509  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.38 
 
 		 411 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0494  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.38 
 
 		 411 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2031  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.38 
 
 		 408 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0311  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.63 
 
 		 408 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3293  L,L-diaminopimelate aminotransferase  68.4 
 
 		 411 aa  604  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.792404  decreased coverage  0.00697344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4059  L,L-diaminopimelate aminotransferase  68.23 
 
 		 411 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0853  L,L-diaminopimelate aminotransferase  66.42 
 
 		 411 aa  594  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217772  hitchhiker  0.00920973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2354  L,L-diaminopimelate aminotransferase  65.43 
 
 		 411 aa  588  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1424  LL-diaminopimelate aminotransferase  65.43 
 
 		 411 aa  587  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3995  aminotransferase class I and II  64.94 
 
 		 411 aa  587  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16221  L,L-diaminopimelate aminotransferase  69.85 
 
 		 408 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.516745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4424  L,L-diaminopimelate aminotransferase  64.69 
 
 		 411 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0886982 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1351  L,L-diaminopimelate aminotransferase  61.98 
 
 		 407 aa  536  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0206949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0238  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.49 
 
 		 410 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3101  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.82 
 
 		 410 aa  530  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0213  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.25 
 
 		 410 aa  521  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0427359  hitchhiker  0.00000000000342652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4564  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.87 
 
 		 411 aa  518  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0162  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60 
 
 		 410 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2324  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.23 
 
 		 409 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2423  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.75 
 
 		 410 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0671346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3040  L,L-diaminopimelate aminotransferase  59.26 
 
 		 410 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4142  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.25 
 
 		 411 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4052  L,L-diaminopimelate aminotransferase  60.25 
 
 		 411 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3061  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.52 
 
 		 410 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371159  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1014  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.52 
 
 		 409 aa  513  1e-144  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4620  L,L-diaminopimelate aminotransferase  57.53 
 
 		 407 aa  510  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1185  L,L-diaminopimelate aminotransferase  56.59 
 
 		 531 aa  508  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0704  L,L-diaminopimelate aminotransferase  58.09 
 
 		 407 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167221  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1151  aminotransferase class I and II  52.21 
 
 		 408 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2779  L,L-diaminopimelate aminotransferase  53.92 
 
 		 409 aa  474  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0363182  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0631  L,L-diaminopimelate aminotransferase  54.52 
 
 		 404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.923394  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00770  LL-diaminopimelate aminotransferase  45.37 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.386201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22909  predicted protein  47.19 
 
 		 443 aa  342  1e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30412  predicted protein  42.89 
 
 		 402 aa  333  4e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00618284  normal  0.581125 
 
 
-
 
NC_002620  TC0669  L,L-diaminopimelate aminotransferase  39.45 
 
 		 393 aa  292  8e-78  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  32.59 
 
 		 386 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.17 
 
 		 387 aa  164  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  27.96 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  31.43 
 
 		 390 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.02 
 
 		 390 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.43 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.39 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  29.33 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.39 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.62 
 
 		 389 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  29.4 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  29.6 
 
 		 392 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  30.39 
 
 		 390 aa  142  8e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  29.15 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  29.15 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  29.15 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  29.15 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  29.15 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  29.15 
 
 		 392 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  30.2 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  28.82 
 
 		 392 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  29.68 
 
 		 401 aa  139  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  27.99 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.9 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  27.81 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  28.64 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.34 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  29.6 
 
 		 392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.25 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  28.61 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.7 
 
 		 391 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  27.78 
 
 		 387 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  28.14 
 
 		 396 aa  133  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  27.7 
 
 		 400 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  28.61 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  28.07 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  27.39 
 
 		 403 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.87 
 
 		 392 aa  126  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.5 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  27.38 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  27.82 
 
 		 388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  26.25 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  27.13 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  27.39 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  27.01 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  27.3 
 
 		 402 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  27.56 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  26.29 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07380  aminotransferase  25.8 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  27.06 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  27.59 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  26.37 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  27.01 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  27.27 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  27.06 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  28.14 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  26.55 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  28.52 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>