111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_16231 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_16231  GTPase SAR1 and related small G proteins  100 
 
 		 413 aa  815    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.283634  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  66.1 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16461  GTPase SAR1  63.68 
 
 		 413 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16341  GTPase SAR1 and related small G protein  65.13 
 
 		 413 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  39.68 
 
 		 440 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  39.74 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.47 
 
 		 440 aa  269  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04921  GTPase SAR1  33.33 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0497  GTPase  30.26 
 
 		 420 aa  226  4e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2178  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.86 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.995116  normal  0.41065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1080  small GTP-binding protein  30 
 
 		 484 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0499  small GTP-binding protein  29.46 
 
 		 475 aa  176  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362987  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  28.19 
 
 		 489 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3291  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.91 
 
 		 492 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  28.79 
 
 		 566 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1436  small GTP-binding protein  28.54 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.741449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1407  small GTP-binding protein  28.54 
 
 		 479 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0107  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.63 
 
 		 472 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1616  small GTP-binding protein  27.6 
 
 		 453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3709  small GTP-binding protein  31 
 
 		 462 aa  135  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4509  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.43 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2342  small GTP-binding protein  28.66 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2393  small GTP-binding protein  28.66 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3839  small GTP-binding protein  26.8 
 
 		 481 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.674432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0764  GTP-binding protein HSR1-related  28.07 
 
 		 469 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1709  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.58 
 
 		 513 aa  96.7  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000711006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0884  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.52 
 
 		 499 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102699  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16501  GTPase SAR1 and related small G proteins  24.91 
 
 		 532 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.569133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1544  small GTP-binding protein domain-containing protein  23.93 
 
 		 517 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  23.94 
 
 		 531 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4459  small GTP-binding protein  24.09 
 
 		 520 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.859915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0145  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.01 
 
 		 517 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  23.94 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  23.6 
 
 		 529 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4593  small GTP-binding protein  23.15 
 
 		 506 aa  84.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.771946  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09451  GTPase SAR1  28.2 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07771  GTPase SAR1 and related small G proteins  27.3 
 
 		 517 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0362439 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09991  GTPase SAR1 and related small G proteins  28.57 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09441  GTPase SAR1 and related small G protein  27.91 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10221  GTPase SAR1 and related small G protein  23.31 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.524471  normal  0.183753 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1260  hypothetical protein  22.73 
 
 		 529 aa  80.9  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1904  GTP-binding protein, HSR1-related  26.81 
 
 		 545 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1210  small GTP-binding protein domain-containing protein  22.52 
 
 		 529 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0916  small GTP-binding protein  28.43 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.704291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3840  hypothetical protein  24.76 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.693476 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl014  tRNA modification GTPase TrmE  31.25 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0765  hypothetical protein  19.33 
 
 		 472 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3579  hypothetical protein  23.03 
 
 		 463 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2527  hypothetical protein  22.73 
 
 		 463 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0993  hypothetical protein  22.89 
 
 		 459 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.455493 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_2271  predicted protein  20.4 
 
 		 489 aa  50.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4193  hypothetical protein  20.75 
 
 		 471 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  26.23 
 
 		 452 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  26.23 
 
 		 452 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2662  small GTP-binding protein  23.83 
 
 		 453 aa  50.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.144738  hitchhiker  0.00576403 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  23.74 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0966  ferrous iron transport protein B  28.3 
 
 		 669 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3142  tRNA modification GTPase TrmE  25.87 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  27.6 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  27.08 
 
 		 460 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  31.82 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  26.9 
 
 		 548 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  27.6 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0536  putative GTP-binding protein EngA  28.1 
 
 		 473 aa  47.8  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3465  tRNA modification GTPase TrmE  27.66 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  26.28 
 
 		 494 aa  47.4  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0333  GTP-binding protein EngA  28.68 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  27.03 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2758  tRNA modification GTPase TrmE  30.49 
 
 		 455 aa  47.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.294935  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12578  putative tRNA modification GTPase  27.27 
 
 		 469 aa  47  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  32.26 
 
 		 461 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  26.86 
 
 		 669 aa  46.6  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  29.7 
 
 		 460 aa  46.6  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3000  GTP-binding protein  26.54 
 
 		 472 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0732  hypothetical protein  20 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00108673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.45 
 
 		 637 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1230  hypothetical protein  29.55 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  27.84 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1233  small GTP-binding protein  21.99 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.765411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  26.29 
 
 		 667 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  31.71 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  26.45 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1430  tRNA modification GTPase TrmE  26.85 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26.32 
 
 		 546 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2410  tRNA modification GTPase TrmE  29.08 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.749558  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0925  hypothetical protein  32.1 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  31.88 
 
 		 462 aa  44.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3941  tRNA modification GTPase TrmE  29.58 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  27.71 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  30.65 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  29.55 
 
 		 562 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  27.66 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  25.53 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  30.77 
 
 		 294 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  30.77 
 
 		 294 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0400  GTP-binding protein EngA  23.39 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.758155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  24.05 
 
 		 338 aa  43.5  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  25.66 
 
 		 697 aa  43.9  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0307  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  22.92 
 
 		 219 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186565 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1169  GTP-binding protein EngA  25.84 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.306254 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>