250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_15721 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_15721  putative permease  100 
 
 		 386 aa  777    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  57.03 
 
 		 401 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  56.23 
 
 		 401 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  52.52 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  50.92 
 
 		 401 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  50.92 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  49.87 
 
 		 395 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  49.33 
 
 		 395 aa  355  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  45.79 
 
 		 384 aa  352  7e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  41.74 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  36 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  36.8 
 
 		 391 aa  255  9e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  35.86 
 
 		 388 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  34.83 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  36.87 
 
 		 391 aa  244  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  35.73 
 
 		 393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  35.73 
 
 		 393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  33.16 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  33.16 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  32.53 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  32.28 
 
 		 374 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  30.21 
 
 		 434 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  27.89 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  26.01 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.42 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  29.47 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 		 356 aa  117  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  29.5 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  25.48 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25.47 
 
 		 399 aa  96.3  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  25.98 
 
 		 1040 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  24.94 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  23.64 
 
 		 361 aa  87  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  25.15 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 		 792 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  23.66 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  23.32 
 
 		 1153 aa  83.2  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  24.29 
 
 		 1096 aa  82.8  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  19.85 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  22.4 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  24.56 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.91 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  24.17 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  22.73 
 
 		 1061 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  24.6 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  21.43 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  21.61 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  22.16 
 
 		 1061 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25.37 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  19.65 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  22.55 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  23.91 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  22.84 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.05 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  21.52 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  23.48 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  25.66 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  23.43 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  20.87 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  23.22 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  23.49 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  20.53 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  22.76 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  30.66 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  22.76 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  21.34 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  27.09 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  21.63 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  21.1 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  21.74 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.69 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  21.91 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  23.93 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  20.91 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  20.06 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  21.26 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  22.07 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  19.71 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  19.58 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  20.44 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  20.82 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  24.63 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  20.48 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  21.78 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  20.91 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  20.74 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  24.1 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  21.04 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>