65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_15601 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  81.69 
 
 
388 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  100 
 
 
375 aa  768    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  79.08 
 
 
391 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  82.15 
 
 
344 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  64.85 
 
 
405 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  64.93 
 
 
405 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  61.75 
 
 
380 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  48.44 
 
 
495 aa  368  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  49.73 
 
 
387 aa  353  2e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  47.49 
 
 
362 aa  342  7e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  40.97 
 
 
381 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  62.01 
 
 
180 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  36.97 
 
 
436 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06461  hypothetical protein  72.44 
 
 
141 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.309597 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  35.22 
 
 
471 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  31.66 
 
 
448 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  32.71 
 
 
435 aa  192  8e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  33.43 
 
 
418 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  31.5 
 
 
359 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  31.34 
 
 
359 aa  175  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  32.18 
 
 
394 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  30.64 
 
 
360 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  30.11 
 
 
357 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  27.76 
 
 
435 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  26.46 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  26.61 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  24.62 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  22.36 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  22.36 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  20.31 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  24.85 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  25.28 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  24.17 
 
 
374 aa  60.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  23.43 
 
 
357 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  27.34 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  25.16 
 
 
349 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  28.69 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  24.09 
 
 
376 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  27.78 
 
 
374 aa  53.1  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  27.78 
 
 
374 aa  53.1  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  30.36 
 
 
286 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  28.57 
 
 
328 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  22.33 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  22.33 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  22.33 
 
 
343 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  22.33 
 
 
343 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  30.49 
 
 
349 aa  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  22.12 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  20.62 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  21.22 
 
 
319 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  22.93 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  20.62 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  21.22 
 
 
343 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  22.37 
 
 
343 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  21.22 
 
 
343 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  31.58 
 
 
351 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  24.57 
 
 
356 aa  46.2  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  29.33 
 
 
352 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  29.33 
 
 
353 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  26.48 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3762  fatty acid desaturase  31.97 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761835  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  28.89 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  23.56 
 
 
362 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  30.77 
 
 
368 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2215  fatty acid desaturase  30.43 
 
 
362 aa  43.1  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>