92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_14071 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_14071  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  720    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0536684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  29.78 
 
 
303 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  27.32 
 
 
457 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  20.21 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  30.43 
 
 
285 aa  63.5  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  26.11 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  36.89 
 
 
306 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  23.33 
 
 
236 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  25 
 
 
382 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  30.41 
 
 
273 aa  59.7  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  27.5 
 
 
358 aa  59.7  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  22.77 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 
323 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  25.29 
 
 
323 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
332 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  25.75 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2892  methyltransferase type 12  22.86 
 
 
311 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.63 
 
 
303 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
298 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  23.79 
 
 
287 aa  56.6  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.43 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  22.12 
 
 
274 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  25.5 
 
 
243 aa  52.8  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  19.63 
 
 
310 aa  53.1  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  21.72 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0448  methyltransferase type 12  24.76 
 
 
307 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00834451  normal  0.0296348 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
282 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2729  Methyltransferase type 11  22.02 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  21.43 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.80361 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  22.14 
 
 
238 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  21.78 
 
 
300 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  20 
 
 
275 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  29.7 
 
 
233 aa  49.7  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  23.56 
 
 
267 aa  49.7  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  20.98 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  25.28 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  28.96 
 
 
310 aa  47.8  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  21.59 
 
 
519 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2563  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
246 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2887  SAM-binding motif-containing protein  26.8 
 
 
237 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.015318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  21.79 
 
 
317 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  25 
 
 
248 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 
208 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  24.47 
 
 
303 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  24.75 
 
 
312 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
298 aa  46.6  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  21.74 
 
 
414 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  27.59 
 
 
310 aa  46.6  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  23.53 
 
 
297 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  28.44 
 
 
330 aa  46.6  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  30 
 
 
226 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0939  Methyltransferase type 12  31.2 
 
 
232 aa  46.6  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  26.36 
 
 
323 aa  46.6  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0628  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.61 
 
 
230 aa  46.6  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308347  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001055  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  25.61 
 
 
214 aa  46.2  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  21 
 
 
251 aa  46.2  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  21.08 
 
 
291 aa  46.2  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  30.19 
 
 
215 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1837  methyltransferase type 12  26.92 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.322151  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  26.15 
 
 
214 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  29.52 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  21.91 
 
 
247 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  29.63 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
1162 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  26.17 
 
 
248 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  25.4 
 
 
248 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  25.16 
 
 
407 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  23.08 
 
 
318 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5566  methyltransferase type 12  24.07 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.509991  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
1523 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  21.55 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1690  methyltransferase type 11  24.75 
 
 
235 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5240  hypothetical protein  42.22 
 
 
245 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313704  normal  0.432968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  21.88 
 
 
324 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  25.45 
 
 
251 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  22.49 
 
 
406 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  21.88 
 
 
244 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  35.8 
 
 
194 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1838  hypothetical protein  27.34 
 
 
142 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  27.03 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0194  hypothetical protein  25.86 
 
 
304 aa  43.9  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  25.23 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  31.13 
 
 
231 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0955  methyltransferase type 12  30.4 
 
 
313 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.978097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.42 
 
 
277 aa  43.5  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  27.07 
 
 
233 aa  43.1  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1633  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  31.58 
 
 
897 aa  42.7  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0549142  normal  0.0235477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
194 aa  42.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0609  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
221 aa  42.7  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.304159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>